Protein–RNA interactions for Protein: Q96M91

CFAP53, Cilia- and flagella-associated protein 53, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP53Q96M91 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CFAP53Q96M91 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CFAP53Q96M91 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CFAP53Q96M91 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CFAP53Q96M91 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CFAP53Q96M91 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
CFAP53Q96M91 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
CFAP53Q96M91 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CFAP53Q96M91 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CFAP53Q96M91 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CFAP53Q96M91 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CFAP53Q96M91 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CFAP53Q96M91 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CFAP53Q96M91 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CFAP53Q96M91 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CFAP53Q96M91 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CFAP53Q96M91 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CFAP53Q96M91 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CFAP53Q96M91 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CFAP53Q96M91 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CFAP53Q96M91 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CFAP53Q96M91 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CFAP53Q96M91 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CFAP53Q96M91 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CFAP53Q96M91 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CFAP53Q96M91 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CFAP53Q96M91 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
CFAP53Q96M91 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CFAP53Q96M91 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CFAP53Q96M91 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CFAP53Q96M91 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CFAP53Q96M91 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CFAP53Q96M91 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CFAP53Q96M91 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CFAP53Q96M91 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CFAP53Q96M91 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
CFAP53Q96M91 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CFAP53Q96M91 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CFAP53Q96M91 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CFAP53Q96M91 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CFAP53Q96M91 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CFAP53Q96M91 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CFAP53Q96M91 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
CFAP53Q96M91 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CFAP53Q96M91 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CFAP53Q96M91 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CFAP53Q96M91 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CFAP53Q96M91 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CFAP53Q96M91 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CFAP53Q96M91 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CFAP53Q96M91 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CFAP53Q96M91 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CFAP53Q96M91 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CFAP53Q96M91 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CFAP53Q96M91 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CFAP53Q96M91 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CFAP53Q96M91 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CFAP53Q96M91 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CFAP53Q96M91 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CFAP53Q96M91 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CFAP53Q96M91 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CFAP53Q96M91 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
CFAP53Q96M91 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CFAP53Q96M91 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CFAP53Q96M91 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CFAP53Q96M91 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CFAP53Q96M91 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CFAP53Q96M91 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CFAP53Q96M91 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CFAP53Q96M91 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CFAP53Q96M91 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CFAP53Q96M91 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CFAP53Q96M91 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CFAP53Q96M91 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CFAP53Q96M91 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CFAP53Q96M91 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CFAP53Q96M91 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CFAP53Q96M91 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CFAP53Q96M91 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CFAP53Q96M91 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CFAP53Q96M91 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CFAP53Q96M91 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CFAP53Q96M91 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CFAP53Q96M91 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CFAP53Q96M91 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CFAP53Q96M91 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
CFAP53Q96M91 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CFAP53Q96M91 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CFAP53Q96M91 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CFAP53Q96M91 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CFAP53Q96M91 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CFAP53Q96M91 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CFAP53Q96M91 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CFAP53Q96M91 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CFAP53Q96M91 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CFAP53Q96M91 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CFAP53Q96M91 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CFAP53Q96M91 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CFAP53Q96M91 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CFAP53Q96M91 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms