Protein–RNA interactions for Protein: Q96LX7

CCDC17, Coiled-coil domain-containing protein 17, humanhuman

Predictions only

Length 622 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC17Q96LX7 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC17Q96LX7 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC17Q96LX7 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC17Q96LX7 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC17Q96LX7 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC17Q96LX7 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC17Q96LX7 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC17Q96LX7 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC17Q96LX7 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC17Q96LX7 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC17Q96LX7 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC17Q96LX7 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC17Q96LX7 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC17Q96LX7 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC17Q96LX7 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC17Q96LX7 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC17Q96LX7 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC17Q96LX7 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC17Q96LX7 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC17Q96LX7 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC17Q96LX7 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC17Q96LX7 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC17Q96LX7 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC17Q96LX7 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC17Q96LX7 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC17Q96LX7 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC17Q96LX7 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC17Q96LX7 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC17Q96LX7 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC17Q96LX7 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC17Q96LX7 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC17Q96LX7 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC17Q96LX7 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC17Q96LX7 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC17Q96LX7 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC17Q96LX7 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC17Q96LX7 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC17Q96LX7 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC17Q96LX7 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC17Q96LX7 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC17Q96LX7 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC17Q96LX7 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC17Q96LX7 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC17Q96LX7 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC17Q96LX7 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC17Q96LX7 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC17Q96LX7 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC17Q96LX7 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC17Q96LX7 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC17Q96LX7 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC17Q96LX7 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC17Q96LX7 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC17Q96LX7 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC17Q96LX7 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC17Q96LX7 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC17Q96LX7 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC17Q96LX7 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC17Q96LX7 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC17Q96LX7 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC17Q96LX7 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC17Q96LX7 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC17Q96LX7 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC17Q96LX7 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC17Q96LX7 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC17Q96LX7 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC17Q96LX7 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC17Q96LX7 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC17Q96LX7 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC17Q96LX7 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC17Q96LX7 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC17Q96LX7 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC17Q96LX7 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC17Q96LX7 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC17Q96LX7 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC17Q96LX7 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC17Q96LX7 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC17Q96LX7 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC17Q96LX7 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC17Q96LX7 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC17Q96LX7 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC17Q96LX7 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC17Q96LX7 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC17Q96LX7 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC17Q96LX7 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC17Q96LX7 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC17Q96LX7 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC17Q96LX7 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC17Q96LX7 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC17Q96LX7 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC17Q96LX7 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CCDC17Q96LX7 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
CCDC17Q96LX7 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC17Q96LX7 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC17Q96LX7 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC17Q96LX7 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC17Q96LX7 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC17Q96LX7 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC17Q96LX7 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC17Q96LX7 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC17Q96LX7 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms