Protein–RNA interactions for Protein: Q96JN2

CCDC136, Coiled-coil domain-containing protein 136, humanhuman

Predictions only

Length 1,154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC136Q96JN2 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC136Q96JN2 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC136Q96JN2 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC136Q96JN2 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC136Q96JN2 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC136Q96JN2 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC136Q96JN2 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC136Q96JN2 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC136Q96JN2 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC136Q96JN2 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC136Q96JN2 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC136Q96JN2 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC136Q96JN2 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC136Q96JN2 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC136Q96JN2 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC136Q96JN2 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC136Q96JN2 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC136Q96JN2 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC136Q96JN2 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC136Q96JN2 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC136Q96JN2 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC136Q96JN2 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC136Q96JN2 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC136Q96JN2 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC136Q96JN2 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC136Q96JN2 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC136Q96JN2 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC136Q96JN2 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC136Q96JN2 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC136Q96JN2 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC136Q96JN2 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC136Q96JN2 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC136Q96JN2 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC136Q96JN2 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC136Q96JN2 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC136Q96JN2 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC136Q96JN2 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC136Q96JN2 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC136Q96JN2 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC136Q96JN2 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC136Q96JN2 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC136Q96JN2 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC136Q96JN2 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC136Q96JN2 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC136Q96JN2 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC136Q96JN2 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC136Q96JN2 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC136Q96JN2 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC136Q96JN2 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC136Q96JN2 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC136Q96JN2 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC136Q96JN2 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC136Q96JN2 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC136Q96JN2 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC136Q96JN2 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC136Q96JN2 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC136Q96JN2 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC136Q96JN2 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC136Q96JN2 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC136Q96JN2 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC136Q96JN2 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC136Q96JN2 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC136Q96JN2 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC136Q96JN2 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC136Q96JN2 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC136Q96JN2 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC136Q96JN2 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC136Q96JN2 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC136Q96JN2 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC136Q96JN2 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC136Q96JN2 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC136Q96JN2 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC136Q96JN2 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC136Q96JN2 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC136Q96JN2 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC136Q96JN2 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC136Q96JN2 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC136Q96JN2 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC136Q96JN2 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC136Q96JN2 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC136Q96JN2 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC136Q96JN2 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC136Q96JN2 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC136Q96JN2 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC136Q96JN2 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC136Q96JN2 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC136Q96JN2 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC136Q96JN2 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC136Q96JN2 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC136Q96JN2 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC136Q96JN2 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC136Q96JN2 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC136Q96JN2 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC136Q96JN2 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC136Q96JN2 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC136Q96JN2 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC136Q96JN2 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC136Q96JN2 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC136Q96JN2 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC136Q96JN2 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms