Protein–RNA interactions for Protein: Q96EP9

SLC10A4, Sodium/bile acid cotransporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC10A4Q96EP9 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC10A4Q96EP9 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC10A4Q96EP9 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC10A4Q96EP9 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC10A4Q96EP9 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC10A4Q96EP9 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC10A4Q96EP9 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC10A4Q96EP9 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC10A4Q96EP9 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC10A4Q96EP9 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC10A4Q96EP9 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC10A4Q96EP9 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC10A4Q96EP9 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC10A4Q96EP9 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC10A4Q96EP9 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC10A4Q96EP9 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC10A4Q96EP9 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC10A4Q96EP9 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC10A4Q96EP9 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC10A4Q96EP9 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC10A4Q96EP9 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC10A4Q96EP9 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC10A4Q96EP9 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC10A4Q96EP9 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC10A4Q96EP9 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC10A4Q96EP9 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC10A4Q96EP9 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC10A4Q96EP9 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC10A4Q96EP9 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC10A4Q96EP9 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC10A4Q96EP9 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
SLC10A4Q96EP9 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
SLC10A4Q96EP9 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
SLC10A4Q96EP9 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC10A4Q96EP9 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC10A4Q96EP9 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC10A4Q96EP9 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC10A4Q96EP9 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC10A4Q96EP9 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC10A4Q96EP9 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC10A4Q96EP9 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC10A4Q96EP9 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC10A4Q96EP9 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC10A4Q96EP9 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC10A4Q96EP9 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC10A4Q96EP9 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC10A4Q96EP9 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC10A4Q96EP9 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC10A4Q96EP9 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC10A4Q96EP9 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC10A4Q96EP9 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC10A4Q96EP9 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC10A4Q96EP9 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC10A4Q96EP9 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC10A4Q96EP9 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC10A4Q96EP9 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC10A4Q96EP9 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC10A4Q96EP9 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC10A4Q96EP9 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC10A4Q96EP9 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC10A4Q96EP9 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC10A4Q96EP9 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC10A4Q96EP9 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC10A4Q96EP9 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC10A4Q96EP9 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC10A4Q96EP9 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC10A4Q96EP9 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC10A4Q96EP9 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC10A4Q96EP9 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC10A4Q96EP9 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC10A4Q96EP9 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC10A4Q96EP9 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC10A4Q96EP9 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC10A4Q96EP9 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC10A4Q96EP9 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC10A4Q96EP9 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC10A4Q96EP9 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC10A4Q96EP9 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC10A4Q96EP9 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC10A4Q96EP9 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC10A4Q96EP9 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC10A4Q96EP9 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC10A4Q96EP9 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC10A4Q96EP9 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC10A4Q96EP9 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC10A4Q96EP9 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC10A4Q96EP9 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC10A4Q96EP9 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC10A4Q96EP9 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC10A4Q96EP9 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC10A4Q96EP9 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC10A4Q96EP9 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC10A4Q96EP9 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC10A4Q96EP9 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC10A4Q96EP9 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC10A4Q96EP9 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC10A4Q96EP9 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC10A4Q96EP9 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC10A4Q96EP9 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC10A4Q96EP9 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.4 ms