Protein–RNA interactions for Protein: Q96DT6

ATG4C, Cysteine protease ATG4C, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4CQ96DT6 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATG4CQ96DT6 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATG4CQ96DT6 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATG4CQ96DT6 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATG4CQ96DT6 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATG4CQ96DT6 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATG4CQ96DT6 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATG4CQ96DT6 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATG4CQ96DT6 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATG4CQ96DT6 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATG4CQ96DT6 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATG4CQ96DT6 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATG4CQ96DT6 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATG4CQ96DT6 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATG4CQ96DT6 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
ATG4CQ96DT6 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATG4CQ96DT6 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATG4CQ96DT6 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
ATG4CQ96DT6 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATG4CQ96DT6 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATG4CQ96DT6 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATG4CQ96DT6 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATG4CQ96DT6 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ATG4CQ96DT6 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.99
ATG4CQ96DT6 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ATG4CQ96DT6 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ATG4CQ96DT6 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ATG4CQ96DT6 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ATG4CQ96DT6 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ATG4CQ96DT6 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ATG4CQ96DT6 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ATG4CQ96DT6 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ATG4CQ96DT6 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ATG4CQ96DT6 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ATG4CQ96DT6 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ATG4CQ96DT6 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
ATG4CQ96DT6 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ATG4CQ96DT6 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ATG4CQ96DT6 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
ATG4CQ96DT6 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ATG4CQ96DT6 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ATG4CQ96DT6 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ATG4CQ96DT6 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ATG4CQ96DT6 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ATG4CQ96DT6 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ATG4CQ96DT6 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ATG4CQ96DT6 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
ATG4CQ96DT6 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ATG4CQ96DT6 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ATG4CQ96DT6 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ATG4CQ96DT6 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ATG4CQ96DT6 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ATG4CQ96DT6 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ATG4CQ96DT6 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ATG4CQ96DT6 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ATG4CQ96DT6 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ATG4CQ96DT6 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ATG4CQ96DT6 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
ATG4CQ96DT6 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
ATG4CQ96DT6 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ATG4CQ96DT6 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ATG4CQ96DT6 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ATG4CQ96DT6 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ATG4CQ96DT6 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ATG4CQ96DT6 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ATG4CQ96DT6 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ATG4CQ96DT6 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ATG4CQ96DT6 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ATG4CQ96DT6 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ATG4CQ96DT6 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ATG4CQ96DT6 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ATG4CQ96DT6 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ATG4CQ96DT6 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
ATG4CQ96DT6 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ATG4CQ96DT6 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ATG4CQ96DT6 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ATG4CQ96DT6 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ATG4CQ96DT6 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ATG4CQ96DT6 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ATG4CQ96DT6 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ATG4CQ96DT6 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ATG4CQ96DT6 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ATG4CQ96DT6 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ATG4CQ96DT6 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ATG4CQ96DT6 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ATG4CQ96DT6 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ATG4CQ96DT6 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ATG4CQ96DT6 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ATG4CQ96DT6 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ATG4CQ96DT6 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ATG4CQ96DT6 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ATG4CQ96DT6 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
ATG4CQ96DT6 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ATG4CQ96DT6 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ATG4CQ96DT6 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ATG4CQ96DT6 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ATG4CQ96DT6 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ATG4CQ96DT6 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ATG4CQ96DT6 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ATG4CQ96DT6 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms