Protein–RNA interactions for Protein: Q969X6

UTP4, U3 small nucleolar RNA-associated protein 4 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 686 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP4Q969X6 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
UTP4Q969X6 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
UTP4Q969X6 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
UTP4Q969X6 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
UTP4Q969X6 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
UTP4Q969X6 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
UTP4Q969X6 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
UTP4Q969X6 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
UTP4Q969X6 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
UTP4Q969X6 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
UTP4Q969X6 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
UTP4Q969X6 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
UTP4Q969X6 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
UTP4Q969X6 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
UTP4Q969X6 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
UTP4Q969X6 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
UTP4Q969X6 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
UTP4Q969X6 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
UTP4Q969X6 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
UTP4Q969X6 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
UTP4Q969X6 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
UTP4Q969X6 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
UTP4Q969X6 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
UTP4Q969X6 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
UTP4Q969X6 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
UTP4Q969X6 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
UTP4Q969X6 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
UTP4Q969X6 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
UTP4Q969X6 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
UTP4Q969X6 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
UTP4Q969X6 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
UTP4Q969X6 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
UTP4Q969X6 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
UTP4Q969X6 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
UTP4Q969X6 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
UTP4Q969X6 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
UTP4Q969X6 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
UTP4Q969X6 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
UTP4Q969X6 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
UTP4Q969X6 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
UTP4Q969X6 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
UTP4Q969X6 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
UTP4Q969X6 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
UTP4Q969X6 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
UTP4Q969X6 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
UTP4Q969X6 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
UTP4Q969X6 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
UTP4Q969X6 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
UTP4Q969X6 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
UTP4Q969X6 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
UTP4Q969X6 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
UTP4Q969X6 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
UTP4Q969X6 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
UTP4Q969X6 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
UTP4Q969X6 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
UTP4Q969X6 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
UTP4Q969X6 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
UTP4Q969X6 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
UTP4Q969X6 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
UTP4Q969X6 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
UTP4Q969X6 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
UTP4Q969X6 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
UTP4Q969X6 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
UTP4Q969X6 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
UTP4Q969X6 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
UTP4Q969X6 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
UTP4Q969X6 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
UTP4Q969X6 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
UTP4Q969X6 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
UTP4Q969X6 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
UTP4Q969X6 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
UTP4Q969X6 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
UTP4Q969X6 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
UTP4Q969X6 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
UTP4Q969X6 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
UTP4Q969X6 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
UTP4Q969X6 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
UTP4Q969X6 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
UTP4Q969X6 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
UTP4Q969X6 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
UTP4Q969X6 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
UTP4Q969X6 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
UTP4Q969X6 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
UTP4Q969X6 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
UTP4Q969X6 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
UTP4Q969X6 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
UTP4Q969X6 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
UTP4Q969X6 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
UTP4Q969X6 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
UTP4Q969X6 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
UTP4Q969X6 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
UTP4Q969X6 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
UTP4Q969X6 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
UTP4Q969X6 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
UTP4Q969X6 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
UTP4Q969X6 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
UTP4Q969X6 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
UTP4Q969X6 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
UTP4Q969X6 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
UTP4Q969X6 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms