Protein–RNA interactions for Protein: Q969Q1

TRIM63, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM63, humanhuman

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Length 353 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM63Q969Q1 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRIM63Q969Q1 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRIM63Q969Q1 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRIM63Q969Q1 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TRIM63Q969Q1 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRIM63Q969Q1 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRIM63Q969Q1 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRIM63Q969Q1 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRIM63Q969Q1 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRIM63Q969Q1 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRIM63Q969Q1 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRIM63Q969Q1 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRIM63Q969Q1 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRIM63Q969Q1 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRIM63Q969Q1 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRIM63Q969Q1 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRIM63Q969Q1 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRIM63Q969Q1 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRIM63Q969Q1 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
TRIM63Q969Q1 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRIM63Q969Q1 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRIM63Q969Q1 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
TRIM63Q969Q1 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRIM63Q969Q1 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRIM63Q969Q1 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRIM63Q969Q1 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRIM63Q969Q1 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRIM63Q969Q1 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRIM63Q969Q1 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRIM63Q969Q1 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRIM63Q969Q1 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRIM63Q969Q1 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
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TRIM63Q969Q1 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRIM63Q969Q1 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRIM63Q969Q1 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRIM63Q969Q1 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRIM63Q969Q1 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRIM63Q969Q1 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRIM63Q969Q1 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRIM63Q969Q1 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TRIM63Q969Q1 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRIM63Q969Q1 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRIM63Q969Q1 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRIM63Q969Q1 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRIM63Q969Q1 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRIM63Q969Q1 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
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TRIM63Q969Q1 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRIM63Q969Q1 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRIM63Q969Q1 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRIM63Q969Q1 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRIM63Q969Q1 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
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TRIM63Q969Q1 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRIM63Q969Q1 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRIM63Q969Q1 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRIM63Q969Q1 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRIM63Q969Q1 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRIM63Q969Q1 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
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TRIM63Q969Q1 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
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TRIM63Q969Q1 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRIM63Q969Q1 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
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TRIM63Q969Q1 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRIM63Q969Q1 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRIM63Q969Q1 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TRIM63Q969Q1 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRIM63Q969Q1 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRIM63Q969Q1 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRIM63Q969Q1 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRIM63Q969Q1 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRIM63Q969Q1 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRIM63Q969Q1 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRIM63Q969Q1 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRIM63Q969Q1 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRIM63Q969Q1 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
TRIM63Q969Q1 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRIM63Q969Q1 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRIM63Q969Q1 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRIM63Q969Q1 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRIM63Q969Q1 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRIM63Q969Q1 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRIM63Q969Q1 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TRIM63Q969Q1 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
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