Protein–RNA interactions for Protein: Q969G6

RFK, Riboflavin kinase, humanhuman

Predictions only

Length 155 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFKQ969G6 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RFKQ969G6 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RFKQ969G6 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RFKQ969G6 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RFKQ969G6 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RFKQ969G6 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RFKQ969G6 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RFKQ969G6 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RFKQ969G6 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RFKQ969G6 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RFKQ969G6 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RFKQ969G6 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RFKQ969G6 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RFKQ969G6 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RFKQ969G6 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RFKQ969G6 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RFKQ969G6 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RFKQ969G6 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RFKQ969G6 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RFKQ969G6 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RFKQ969G6 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RFKQ969G6 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RFKQ969G6 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RFKQ969G6 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RFKQ969G6 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RFKQ969G6 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RFKQ969G6 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RFKQ969G6 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RFKQ969G6 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RFKQ969G6 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RFKQ969G6 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RFKQ969G6 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RFKQ969G6 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RFKQ969G6 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RFKQ969G6 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RFKQ969G6 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RFKQ969G6 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
RFKQ969G6 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
RFKQ969G6 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RFKQ969G6 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RFKQ969G6 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RFKQ969G6 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RFKQ969G6 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RFKQ969G6 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RFKQ969G6 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RFKQ969G6 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RFKQ969G6 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RFKQ969G6 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RFKQ969G6 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RFKQ969G6 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RFKQ969G6 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RFKQ969G6 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RFKQ969G6 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RFKQ969G6 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
RFKQ969G6 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
RFKQ969G6 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RFKQ969G6 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
RFKQ969G6 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RFKQ969G6 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RFKQ969G6 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RFKQ969G6 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
RFKQ969G6 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RFKQ969G6 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RFKQ969G6 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RFKQ969G6 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RFKQ969G6 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RFKQ969G6 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RFKQ969G6 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RFKQ969G6 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RFKQ969G6 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RFKQ969G6 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RFKQ969G6 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RFKQ969G6 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RFKQ969G6 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RFKQ969G6 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RFKQ969G6 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RFKQ969G6 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RFKQ969G6 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RFKQ969G6 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RFKQ969G6 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RFKQ969G6 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RFKQ969G6 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RFKQ969G6 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RFKQ969G6 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RFKQ969G6 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RFKQ969G6 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RFKQ969G6 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RFKQ969G6 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RFKQ969G6 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RFKQ969G6 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RFKQ969G6 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
RFKQ969G6 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RFKQ969G6 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RFKQ969G6 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RFKQ969G6 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
RFKQ969G6 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RFKQ969G6 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RFKQ969G6 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RFKQ969G6 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RFKQ969G6 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms