Protein–RNA interactions for Protein: Q969E8

TSR2, Pre-rRNA-processing protein TSR2 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 191 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSR2Q969E8 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TSR2Q969E8 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
TSR2Q969E8 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TSR2Q969E8 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TSR2Q969E8 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TSR2Q969E8 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TSR2Q969E8 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC24■■□□□ 1.43
TSR2Q969E8 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TSR2Q969E8 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC24■■□□□ 1.43
TSR2Q969E8 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
TSR2Q969E8 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC24■■□□□ 1.43
TSR2Q969E8 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TSR2Q969E8 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TSR2Q969E8 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TSR2Q969E8 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TSR2Q969E8 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
TSR2Q969E8 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TSR2Q969E8 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TSR2Q969E8 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
TSR2Q969E8 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TSR2Q969E8 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TSR2Q969E8 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TSR2Q969E8 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TSR2Q969E8 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TSR2Q969E8 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TSR2Q969E8 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TSR2Q969E8 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TSR2Q969E8 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
TSR2Q969E8 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TSR2Q969E8 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
TSR2Q969E8 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TSR2Q969E8 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TSR2Q969E8 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TSR2Q969E8 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TSR2Q969E8 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TSR2Q969E8 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TSR2Q969E8 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TSR2Q969E8 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TSR2Q969E8 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TSR2Q969E8 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TSR2Q969E8 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TSR2Q969E8 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TSR2Q969E8 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
TSR2Q969E8 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TSR2Q969E8 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TSR2Q969E8 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
TSR2Q969E8 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TSR2Q969E8 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TSR2Q969E8 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TSR2Q969E8 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TSR2Q969E8 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TSR2Q969E8 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TSR2Q969E8 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TSR2Q969E8 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TSR2Q969E8 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TSR2Q969E8 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TSR2Q969E8 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TSR2Q969E8 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TSR2Q969E8 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TSR2Q969E8 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TSR2Q969E8 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TSR2Q969E8 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TSR2Q969E8 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TSR2Q969E8 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TSR2Q969E8 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TSR2Q969E8 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TSR2Q969E8 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TSR2Q969E8 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TSR2Q969E8 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
TSR2Q969E8 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TSR2Q969E8 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TSR2Q969E8 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TSR2Q969E8 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TSR2Q969E8 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TSR2Q969E8 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TSR2Q969E8 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
TSR2Q969E8 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TSR2Q969E8 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TSR2Q969E8 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TSR2Q969E8 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TSR2Q969E8 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TSR2Q969E8 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TSR2Q969E8 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TSR2Q969E8 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
TSR2Q969E8 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TSR2Q969E8 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TSR2Q969E8 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TSR2Q969E8 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TSR2Q969E8 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TSR2Q969E8 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TSR2Q969E8 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
TSR2Q969E8 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TSR2Q969E8 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
TSR2Q969E8 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TSR2Q969E8 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TSR2Q969E8 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TSR2Q969E8 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TSR2Q969E8 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
TSR2Q969E8 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TSR2Q969E8 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms