Protein–RNA interactions for Protein: Q92520

FAM3C, Protein FAM3C, humanhuman

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3CQ92520 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
FAM3CQ92520 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
FAM3CQ92520 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FAM3CQ92520 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
FAM3CQ92520 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
FAM3CQ92520 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FAM3CQ92520 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FAM3CQ92520 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FAM3CQ92520 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FAM3CQ92520 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FAM3CQ92520 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
FAM3CQ92520 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
FAM3CQ92520 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FAM3CQ92520 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
FAM3CQ92520 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
FAM3CQ92520 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
FAM3CQ92520 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
FAM3CQ92520 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
FAM3CQ92520 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FAM3CQ92520 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FAM3CQ92520 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FAM3CQ92520 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FAM3CQ92520 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FAM3CQ92520 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FAM3CQ92520 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
FAM3CQ92520 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
FAM3CQ92520 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FAM3CQ92520 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
FAM3CQ92520 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
FAM3CQ92520 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
FAM3CQ92520 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FAM3CQ92520 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
FAM3CQ92520 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FAM3CQ92520 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FAM3CQ92520 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
FAM3CQ92520 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
FAM3CQ92520 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
FAM3CQ92520 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
FAM3CQ92520 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
FAM3CQ92520 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
FAM3CQ92520 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FAM3CQ92520 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
FAM3CQ92520 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
FAM3CQ92520 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
FAM3CQ92520 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
FAM3CQ92520 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
FAM3CQ92520 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
FAM3CQ92520 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FAM3CQ92520 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
FAM3CQ92520 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
FAM3CQ92520 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
FAM3CQ92520 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FAM3CQ92520 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FAM3CQ92520 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
FAM3CQ92520 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FAM3CQ92520 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FAM3CQ92520 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
FAM3CQ92520 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
FAM3CQ92520 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
FAM3CQ92520 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
FAM3CQ92520 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
FAM3CQ92520 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
FAM3CQ92520 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
FAM3CQ92520 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
FAM3CQ92520 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
FAM3CQ92520 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
FAM3CQ92520 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
FAM3CQ92520 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
FAM3CQ92520 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
FAM3CQ92520 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
FAM3CQ92520 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
FAM3CQ92520 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
FAM3CQ92520 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
FAM3CQ92520 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
FAM3CQ92520 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
FAM3CQ92520 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
FAM3CQ92520 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
FAM3CQ92520 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
FAM3CQ92520 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
FAM3CQ92520 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
FAM3CQ92520 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
FAM3CQ92520 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
FAM3CQ92520 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
FAM3CQ92520 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
FAM3CQ92520 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
FAM3CQ92520 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
FAM3CQ92520 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
FAM3CQ92520 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
FAM3CQ92520 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
FAM3CQ92520 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
FAM3CQ92520 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
FAM3CQ92520 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
FAM3CQ92520 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
FAM3CQ92520 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
FAM3CQ92520 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
FAM3CQ92520 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
FAM3CQ92520 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
FAM3CQ92520 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
FAM3CQ92520 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
FAM3CQ92520 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms