Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXI2

CNKSR2, Connector enhancer of kinase suppressor of ras 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,034 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNKSR2Q8WXI2 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CNKSR2Q8WXI2 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CNKSR2Q8WXI2 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CNKSR2Q8WXI2 AC003682.1-201ENST00000599190 462 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CNKSR2Q8WXI2 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CNKSR2Q8WXI2 AC005066.1-201ENST00000613582 1007 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CNKSR2Q8WXI2 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CNKSR2Q8WXI2 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CNKSR2Q8WXI2 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CNKSR2Q8WXI2 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CNKSR2Q8WXI2 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CNKSR2Q8WXI2 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CNKSR2Q8WXI2 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CNKSR2Q8WXI2 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CNKSR2Q8WXI2 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
CNKSR2Q8WXI2 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
CNKSR2Q8WXI2 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
CNKSR2Q8WXI2 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
CNKSR2Q8WXI2 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CNKSR2Q8WXI2 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CNKSR2Q8WXI2 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CNKSR2Q8WXI2 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CNKSR2Q8WXI2 RANP7-201ENST00000418085 644 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CNKSR2Q8WXI2 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CNKSR2Q8WXI2 AC002076.1-201ENST00000435257 527 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CNKSR2Q8WXI2 SMIM30-204ENST00000441359 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CNKSR2Q8WXI2 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CNKSR2Q8WXI2 RNU6-362P-201ENST00000516736 90 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CNKSR2Q8WXI2 AC025437.4-201ENST00000522975 681 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CNKSR2Q8WXI2 AC011853.2-201ENST00000526901 774 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CNKSR2Q8WXI2 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CNKSR2Q8WXI2 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CNKSR2Q8WXI2 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CNKSR2Q8WXI2 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CNKSR2Q8WXI2 AC098617.1-207ENST00000594591 810 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CNKSR2Q8WXI2 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CNKSR2Q8WXI2 AC079416.3-201ENST00000624479 549 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CNKSR2Q8WXI2 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CNKSR2Q8WXI2 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CNKSR2Q8WXI2 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CNKSR2Q8WXI2 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CNKSR2Q8WXI2 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CNKSR2Q8WXI2 IFT74-202ENST00000429045 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CNKSR2Q8WXI2 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CNKSR2Q8WXI2 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CNKSR2Q8WXI2 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CNKSR2Q8WXI2 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CNKSR2Q8WXI2 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CNKSR2Q8WXI2 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CNKSR2Q8WXI2 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CNKSR2Q8WXI2 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CNKSR2Q8WXI2 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CNKSR2Q8WXI2 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CNKSR2Q8WXI2 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CNKSR2Q8WXI2 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CNKSR2Q8WXI2 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CNKSR2Q8WXI2 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CNKSR2Q8WXI2 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CNKSR2Q8WXI2 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CNKSR2Q8WXI2 MYO16-AS2-201ENST00000412809 436 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CNKSR2Q8WXI2 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CNKSR2Q8WXI2 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CNKSR2Q8WXI2 AL133368.2-201ENST00000556978 386 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CNKSR2Q8WXI2 AC023968.2-201ENST00000560593 1049 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CNKSR2Q8WXI2 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CNKSR2Q8WXI2 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CNKSR2Q8WXI2 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CNKSR2Q8WXI2 AC025287.4-201ENST00000640173 1240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CNKSR2Q8WXI2 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CNKSR2Q8WXI2 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CNKSR2Q8WXI2 AC004852.2-204ENST00000614137 1370 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CNKSR2Q8WXI2 KCNMB3-201ENST00000314235 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CNKSR2Q8WXI2 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CNKSR2Q8WXI2 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CNKSR2Q8WXI2 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CNKSR2Q8WXI2 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CNKSR2Q8WXI2 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CNKSR2Q8WXI2 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CNKSR2Q8WXI2 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CNKSR2Q8WXI2 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CNKSR2Q8WXI2 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CNKSR2Q8WXI2 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CNKSR2Q8WXI2 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CNKSR2Q8WXI2 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CNKSR2Q8WXI2 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CNKSR2Q8WXI2 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CNKSR2Q8WXI2 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CNKSR2Q8WXI2 AC104629.2-201ENST00000468627 598 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CNKSR2Q8WXI2 AC022973.3-201ENST00000521014 467 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CNKSR2Q8WXI2 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CNKSR2Q8WXI2 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CNKSR2Q8WXI2 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CNKSR2Q8WXI2 AC011447.3-205ENST00000592022 1268 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CNKSR2Q8WXI2 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CNKSR2Q8WXI2 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CNKSR2Q8WXI2 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CNKSR2Q8WXI2 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CNKSR2Q8WXI2 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CNKSR2Q8WXI2 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CNKSR2Q8WXI2 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms