Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV16

DCAF4, DDB1- and CUL4-associated factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCAF4Q8WV16 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DCAF4Q8WV16 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DCAF4Q8WV16 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
DCAF4Q8WV16 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
DCAF4Q8WV16 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DCAF4Q8WV16 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
DCAF4Q8WV16 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
DCAF4Q8WV16 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DCAF4Q8WV16 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DCAF4Q8WV16 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DCAF4Q8WV16 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DCAF4Q8WV16 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DCAF4Q8WV16 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
DCAF4Q8WV16 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
DCAF4Q8WV16 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
DCAF4Q8WV16 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
DCAF4Q8WV16 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
DCAF4Q8WV16 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
DCAF4Q8WV16 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DCAF4Q8WV16 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DCAF4Q8WV16 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DCAF4Q8WV16 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DCAF4Q8WV16 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DCAF4Q8WV16 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
DCAF4Q8WV16 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DCAF4Q8WV16 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
DCAF4Q8WV16 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DCAF4Q8WV16 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
DCAF4Q8WV16 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DCAF4Q8WV16 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DCAF4Q8WV16 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
DCAF4Q8WV16 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
DCAF4Q8WV16 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DCAF4Q8WV16 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DCAF4Q8WV16 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
DCAF4Q8WV16 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DCAF4Q8WV16 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DCAF4Q8WV16 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
DCAF4Q8WV16 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
DCAF4Q8WV16 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
DCAF4Q8WV16 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
DCAF4Q8WV16 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
DCAF4Q8WV16 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
DCAF4Q8WV16 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
DCAF4Q8WV16 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
DCAF4Q8WV16 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
DCAF4Q8WV16 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
DCAF4Q8WV16 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
DCAF4Q8WV16 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
DCAF4Q8WV16 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
DCAF4Q8WV16 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
DCAF4Q8WV16 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
DCAF4Q8WV16 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
DCAF4Q8WV16 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
DCAF4Q8WV16 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
DCAF4Q8WV16 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
DCAF4Q8WV16 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
DCAF4Q8WV16 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
DCAF4Q8WV16 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
DCAF4Q8WV16 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
DCAF4Q8WV16 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC21.33■■□□□ 1
DCAF4Q8WV16 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
DCAF4Q8WV16 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
DCAF4Q8WV16 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
DCAF4Q8WV16 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
DCAF4Q8WV16 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
DCAF4Q8WV16 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
DCAF4Q8WV16 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
DCAF4Q8WV16 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
DCAF4Q8WV16 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
DCAF4Q8WV16 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
DCAF4Q8WV16 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
DCAF4Q8WV16 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
DCAF4Q8WV16 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
DCAF4Q8WV16 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
DCAF4Q8WV16 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
DCAF4Q8WV16 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
DCAF4Q8WV16 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
DCAF4Q8WV16 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC21.32■■□□□ 1
DCAF4Q8WV16 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC21.32■■□□□ 1
DCAF4Q8WV16 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
DCAF4Q8WV16 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
DCAF4Q8WV16 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
DCAF4Q8WV16 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
DCAF4Q8WV16 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
DCAF4Q8WV16 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
DCAF4Q8WV16 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
DCAF4Q8WV16 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
DCAF4Q8WV16 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
DCAF4Q8WV16 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
DCAF4Q8WV16 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
DCAF4Q8WV16 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
DCAF4Q8WV16 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
DCAF4Q8WV16 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
DCAF4Q8WV16 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
DCAF4Q8WV16 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
DCAF4Q8WV16 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
DCAF4Q8WV16 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
DCAF4Q8WV16 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
DCAF4Q8WV16 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms