Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDN7

ACER1, Alkaline ceramidase 1, humanhuman

Predictions only

Length 264 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACER1Q8TDN7 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ACER1Q8TDN7 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ACER1Q8TDN7 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ACER1Q8TDN7 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ACER1Q8TDN7 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ACER1Q8TDN7 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ACER1Q8TDN7 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ACER1Q8TDN7 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ACER1Q8TDN7 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ACER1Q8TDN7 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ACER1Q8TDN7 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
ACER1Q8TDN7 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ACER1Q8TDN7 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ACER1Q8TDN7 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ACER1Q8TDN7 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
ACER1Q8TDN7 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
ACER1Q8TDN7 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
ACER1Q8TDN7 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ACER1Q8TDN7 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ACER1Q8TDN7 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ACER1Q8TDN7 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ACER1Q8TDN7 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ACER1Q8TDN7 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ACER1Q8TDN7 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ACER1Q8TDN7 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ACER1Q8TDN7 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ACER1Q8TDN7 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ACER1Q8TDN7 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ACER1Q8TDN7 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ACER1Q8TDN7 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
ACER1Q8TDN7 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
ACER1Q8TDN7 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ACER1Q8TDN7 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ACER1Q8TDN7 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ACER1Q8TDN7 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ACER1Q8TDN7 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ACER1Q8TDN7 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ACER1Q8TDN7 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ACER1Q8TDN7 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ACER1Q8TDN7 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
ACER1Q8TDN7 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ACER1Q8TDN7 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
ACER1Q8TDN7 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
ACER1Q8TDN7 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
ACER1Q8TDN7 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ACER1Q8TDN7 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ACER1Q8TDN7 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ACER1Q8TDN7 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
ACER1Q8TDN7 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
ACER1Q8TDN7 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ACER1Q8TDN7 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ACER1Q8TDN7 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
ACER1Q8TDN7 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ACER1Q8TDN7 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ACER1Q8TDN7 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ACER1Q8TDN7 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
ACER1Q8TDN7 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ACER1Q8TDN7 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ACER1Q8TDN7 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ACER1Q8TDN7 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ACER1Q8TDN7 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ACER1Q8TDN7 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ACER1Q8TDN7 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ACER1Q8TDN7 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ACER1Q8TDN7 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ACER1Q8TDN7 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ACER1Q8TDN7 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
ACER1Q8TDN7 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ACER1Q8TDN7 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ACER1Q8TDN7 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ACER1Q8TDN7 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ACER1Q8TDN7 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ACER1Q8TDN7 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ACER1Q8TDN7 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ACER1Q8TDN7 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ACER1Q8TDN7 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ACER1Q8TDN7 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ACER1Q8TDN7 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ACER1Q8TDN7 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ACER1Q8TDN7 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ACER1Q8TDN7 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ACER1Q8TDN7 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ACER1Q8TDN7 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ACER1Q8TDN7 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ACER1Q8TDN7 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ACER1Q8TDN7 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ACER1Q8TDN7 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ACER1Q8TDN7 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ACER1Q8TDN7 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ACER1Q8TDN7 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ACER1Q8TDN7 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ACER1Q8TDN7 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ACER1Q8TDN7 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ACER1Q8TDN7 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ACER1Q8TDN7 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ACER1Q8TDN7 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ACER1Q8TDN7 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ACER1Q8TDN7 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ACER1Q8TDN7 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ACER1Q8TDN7 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms