Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEF3

CCDC112, Coiled-coil domain-containing protein 112, humanhuman

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC112Q8NEF3 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC112Q8NEF3 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC112Q8NEF3 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC112Q8NEF3 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC112Q8NEF3 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC112Q8NEF3 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC112Q8NEF3 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC112Q8NEF3 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC112Q8NEF3 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC112Q8NEF3 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC112Q8NEF3 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC112Q8NEF3 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC112Q8NEF3 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC112Q8NEF3 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC112Q8NEF3 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC112Q8NEF3 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCDC112Q8NEF3 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC112Q8NEF3 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC112Q8NEF3 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC112Q8NEF3 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC112Q8NEF3 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC112Q8NEF3 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC112Q8NEF3 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC112Q8NEF3 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC112Q8NEF3 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC112Q8NEF3 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC112Q8NEF3 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC112Q8NEF3 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC112Q8NEF3 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC112Q8NEF3 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC112Q8NEF3 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC112Q8NEF3 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC112Q8NEF3 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC112Q8NEF3 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC112Q8NEF3 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC112Q8NEF3 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC112Q8NEF3 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC112Q8NEF3 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC112Q8NEF3 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC112Q8NEF3 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC112Q8NEF3 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC112Q8NEF3 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC112Q8NEF3 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC112Q8NEF3 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC112Q8NEF3 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC112Q8NEF3 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC112Q8NEF3 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC112Q8NEF3 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC112Q8NEF3 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC112Q8NEF3 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC112Q8NEF3 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC112Q8NEF3 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC112Q8NEF3 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC112Q8NEF3 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC112Q8NEF3 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC112Q8NEF3 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC112Q8NEF3 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC112Q8NEF3 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC112Q8NEF3 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC112Q8NEF3 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC112Q8NEF3 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC112Q8NEF3 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC112Q8NEF3 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC112Q8NEF3 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC112Q8NEF3 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC112Q8NEF3 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC112Q8NEF3 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC112Q8NEF3 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC112Q8NEF3 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC112Q8NEF3 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC112Q8NEF3 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC112Q8NEF3 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC112Q8NEF3 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC112Q8NEF3 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC112Q8NEF3 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC112Q8NEF3 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC112Q8NEF3 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC112Q8NEF3 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC112Q8NEF3 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC112Q8NEF3 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC112Q8NEF3 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC112Q8NEF3 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC112Q8NEF3 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC112Q8NEF3 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC112Q8NEF3 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC112Q8NEF3 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC112Q8NEF3 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC112Q8NEF3 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC112Q8NEF3 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC112Q8NEF3 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC112Q8NEF3 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC112Q8NEF3 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC112Q8NEF3 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCDC112Q8NEF3 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCDC112Q8NEF3 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCDC112Q8NEF3 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCDC112Q8NEF3 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCDC112Q8NEF3 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCDC112Q8NEF3 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCDC112Q8NEF3 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms