Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6C5

IGSF1, Immunoglobulin superfamily member 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGSF1Q8N6C5 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
IGSF1Q8N6C5 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
IGSF1Q8N6C5 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
IGSF1Q8N6C5 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
IGSF1Q8N6C5 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
IGSF1Q8N6C5 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
IGSF1Q8N6C5 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
IGSF1Q8N6C5 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
IGSF1Q8N6C5 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.48
IGSF1Q8N6C5 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
IGSF1Q8N6C5 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC24.33■■□□□ 1.48
IGSF1Q8N6C5 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC24.33■■□□□ 1.48
IGSF1Q8N6C5 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
IGSF1Q8N6C5 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
IGSF1Q8N6C5 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
IGSF1Q8N6C5 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
IGSF1Q8N6C5 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
IGSF1Q8N6C5 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
IGSF1Q8N6C5 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
IGSF1Q8N6C5 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
IGSF1Q8N6C5 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
IGSF1Q8N6C5 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
IGSF1Q8N6C5 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
IGSF1Q8N6C5 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
IGSF1Q8N6C5 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
IGSF1Q8N6C5 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
IGSF1Q8N6C5 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
IGSF1Q8N6C5 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
IGSF1Q8N6C5 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
IGSF1Q8N6C5 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
IGSF1Q8N6C5 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
IGSF1Q8N6C5 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
IGSF1Q8N6C5 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
IGSF1Q8N6C5 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
IGSF1Q8N6C5 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
IGSF1Q8N6C5 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
IGSF1Q8N6C5 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
IGSF1Q8N6C5 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
IGSF1Q8N6C5 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
IGSF1Q8N6C5 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
IGSF1Q8N6C5 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
IGSF1Q8N6C5 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
IGSF1Q8N6C5 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
IGSF1Q8N6C5 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
IGSF1Q8N6C5 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
IGSF1Q8N6C5 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
IGSF1Q8N6C5 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
IGSF1Q8N6C5 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
IGSF1Q8N6C5 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
IGSF1Q8N6C5 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
IGSF1Q8N6C5 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
IGSF1Q8N6C5 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
IGSF1Q8N6C5 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
IGSF1Q8N6C5 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
IGSF1Q8N6C5 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
IGSF1Q8N6C5 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
IGSF1Q8N6C5 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
IGSF1Q8N6C5 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
IGSF1Q8N6C5 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
IGSF1Q8N6C5 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
IGSF1Q8N6C5 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
IGSF1Q8N6C5 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
IGSF1Q8N6C5 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
IGSF1Q8N6C5 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
IGSF1Q8N6C5 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
IGSF1Q8N6C5 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
IGSF1Q8N6C5 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
IGSF1Q8N6C5 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
IGSF1Q8N6C5 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
IGSF1Q8N6C5 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
IGSF1Q8N6C5 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
IGSF1Q8N6C5 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
IGSF1Q8N6C5 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
IGSF1Q8N6C5 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
IGSF1Q8N6C5 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
IGSF1Q8N6C5 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
IGSF1Q8N6C5 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
IGSF1Q8N6C5 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
IGSF1Q8N6C5 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
IGSF1Q8N6C5 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
IGSF1Q8N6C5 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
IGSF1Q8N6C5 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
IGSF1Q8N6C5 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
IGSF1Q8N6C5 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
IGSF1Q8N6C5 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
IGSF1Q8N6C5 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
IGSF1Q8N6C5 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
IGSF1Q8N6C5 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
IGSF1Q8N6C5 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
IGSF1Q8N6C5 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
IGSF1Q8N6C5 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
IGSF1Q8N6C5 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
IGSF1Q8N6C5 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
IGSF1Q8N6C5 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
IGSF1Q8N6C5 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
IGSF1Q8N6C5 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
IGSF1Q8N6C5 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
IGSF1Q8N6C5 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
IGSF1Q8N6C5 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
IGSF1Q8N6C5 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms