Protein–RNA interactions for Protein: Q8N144

GJD3, Gap junction delta-3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 294 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJD3Q8N144 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GJD3Q8N144 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GJD3Q8N144 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GJD3Q8N144 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GJD3Q8N144 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GJD3Q8N144 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GJD3Q8N144 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GJD3Q8N144 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GJD3Q8N144 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GJD3Q8N144 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GJD3Q8N144 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GJD3Q8N144 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GJD3Q8N144 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GJD3Q8N144 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GJD3Q8N144 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
GJD3Q8N144 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GJD3Q8N144 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GJD3Q8N144 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GJD3Q8N144 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GJD3Q8N144 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GJD3Q8N144 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GJD3Q8N144 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GJD3Q8N144 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GJD3Q8N144 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GJD3Q8N144 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GJD3Q8N144 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GJD3Q8N144 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
GJD3Q8N144 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GJD3Q8N144 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GJD3Q8N144 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GJD3Q8N144 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GJD3Q8N144 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GJD3Q8N144 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GJD3Q8N144 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GJD3Q8N144 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GJD3Q8N144 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GJD3Q8N144 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GJD3Q8N144 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GJD3Q8N144 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GJD3Q8N144 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GJD3Q8N144 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
GJD3Q8N144 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GJD3Q8N144 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GJD3Q8N144 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GJD3Q8N144 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GJD3Q8N144 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GJD3Q8N144 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GJD3Q8N144 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GJD3Q8N144 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GJD3Q8N144 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GJD3Q8N144 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GJD3Q8N144 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GJD3Q8N144 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GJD3Q8N144 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GJD3Q8N144 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GJD3Q8N144 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GJD3Q8N144 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GJD3Q8N144 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GJD3Q8N144 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GJD3Q8N144 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GJD3Q8N144 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GJD3Q8N144 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GJD3Q8N144 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GJD3Q8N144 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GJD3Q8N144 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
GJD3Q8N144 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GJD3Q8N144 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
GJD3Q8N144 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
GJD3Q8N144 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
GJD3Q8N144 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GJD3Q8N144 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
GJD3Q8N144 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
GJD3Q8N144 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GJD3Q8N144 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GJD3Q8N144 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GJD3Q8N144 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GJD3Q8N144 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GJD3Q8N144 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GJD3Q8N144 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GJD3Q8N144 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GJD3Q8N144 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GJD3Q8N144 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GJD3Q8N144 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GJD3Q8N144 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GJD3Q8N144 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
GJD3Q8N144 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GJD3Q8N144 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GJD3Q8N144 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GJD3Q8N144 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
GJD3Q8N144 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GJD3Q8N144 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GJD3Q8N144 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GJD3Q8N144 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GJD3Q8N144 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GJD3Q8N144 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GJD3Q8N144 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GJD3Q8N144 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GJD3Q8N144 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GJD3Q8N144 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GJD3Q8N144 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms