Protein–RNA interactions for Protein: Q71RG4

TMUB2, Transmembrane and ubiquitin-like domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMUB2Q71RG4 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMUB2Q71RG4 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMUB2Q71RG4 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMUB2Q71RG4 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMUB2Q71RG4 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMUB2Q71RG4 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMUB2Q71RG4 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMUB2Q71RG4 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMUB2Q71RG4 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMUB2Q71RG4 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMUB2Q71RG4 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMUB2Q71RG4 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMUB2Q71RG4 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMUB2Q71RG4 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMUB2Q71RG4 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMUB2Q71RG4 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMUB2Q71RG4 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMUB2Q71RG4 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMUB2Q71RG4 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMUB2Q71RG4 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMUB2Q71RG4 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMUB2Q71RG4 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMUB2Q71RG4 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMUB2Q71RG4 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMUB2Q71RG4 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMUB2Q71RG4 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMUB2Q71RG4 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMUB2Q71RG4 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMUB2Q71RG4 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMUB2Q71RG4 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMUB2Q71RG4 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMUB2Q71RG4 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMUB2Q71RG4 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMUB2Q71RG4 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
TMUB2Q71RG4 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMUB2Q71RG4 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMUB2Q71RG4 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMUB2Q71RG4 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMUB2Q71RG4 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMUB2Q71RG4 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMUB2Q71RG4 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMUB2Q71RG4 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMUB2Q71RG4 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMUB2Q71RG4 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMUB2Q71RG4 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMUB2Q71RG4 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMUB2Q71RG4 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMUB2Q71RG4 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMUB2Q71RG4 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMUB2Q71RG4 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMUB2Q71RG4 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMUB2Q71RG4 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMUB2Q71RG4 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMUB2Q71RG4 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMUB2Q71RG4 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMUB2Q71RG4 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMUB2Q71RG4 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMUB2Q71RG4 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMUB2Q71RG4 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMUB2Q71RG4 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMUB2Q71RG4 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMUB2Q71RG4 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMUB2Q71RG4 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
TMUB2Q71RG4 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMUB2Q71RG4 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMUB2Q71RG4 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMUB2Q71RG4 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMUB2Q71RG4 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMUB2Q71RG4 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMUB2Q71RG4 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMUB2Q71RG4 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMUB2Q71RG4 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMUB2Q71RG4 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TMUB2Q71RG4 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TMUB2Q71RG4 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TMUB2Q71RG4 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TMUB2Q71RG4 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TMUB2Q71RG4 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TMUB2Q71RG4 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TMUB2Q71RG4 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TMUB2Q71RG4 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TMUB2Q71RG4 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TMUB2Q71RG4 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TMUB2Q71RG4 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TMUB2Q71RG4 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
TMUB2Q71RG4 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TMUB2Q71RG4 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TMUB2Q71RG4 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TMUB2Q71RG4 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TMUB2Q71RG4 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TMUB2Q71RG4 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TMUB2Q71RG4 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TMUB2Q71RG4 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
TMUB2Q71RG4 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TMUB2Q71RG4 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TMUB2Q71RG4 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
TMUB2Q71RG4 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TMUB2Q71RG4 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
TMUB2Q71RG4 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TMUB2Q71RG4 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.6 ms