Protein–RNA interactions for Protein: Q71F56

MED13L, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 13-like, humanhuman

Predictions only

Length 2,210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED13LQ71F56 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MED13LQ71F56 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MED13LQ71F56 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MED13LQ71F56 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MED13LQ71F56 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MED13LQ71F56 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MED13LQ71F56 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MED13LQ71F56 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MED13LQ71F56 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MED13LQ71F56 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MED13LQ71F56 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MED13LQ71F56 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MED13LQ71F56 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MED13LQ71F56 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MED13LQ71F56 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MED13LQ71F56 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MED13LQ71F56 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MED13LQ71F56 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MED13LQ71F56 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MED13LQ71F56 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MED13LQ71F56 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MED13LQ71F56 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MED13LQ71F56 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MED13LQ71F56 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MED13LQ71F56 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
MED13LQ71F56 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MED13LQ71F56 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
MED13LQ71F56 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
MED13LQ71F56 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MED13LQ71F56 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MED13LQ71F56 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
MED13LQ71F56 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
MED13LQ71F56 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MED13LQ71F56 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
MED13LQ71F56 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
MED13LQ71F56 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MED13LQ71F56 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
MED13LQ71F56 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MED13LQ71F56 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
MED13LQ71F56 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MED13LQ71F56 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MED13LQ71F56 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MED13LQ71F56 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MED13LQ71F56 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MED13LQ71F56 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
MED13LQ71F56 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
MED13LQ71F56 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
MED13LQ71F56 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
MED13LQ71F56 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
MED13LQ71F56 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
MED13LQ71F56 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
MED13LQ71F56 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
MED13LQ71F56 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
MED13LQ71F56 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
MED13LQ71F56 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
MED13LQ71F56 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
MED13LQ71F56 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
MED13LQ71F56 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
MED13LQ71F56 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
MED13LQ71F56 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
MED13LQ71F56 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
MED13LQ71F56 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
MED13LQ71F56 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
MED13LQ71F56 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
MED13LQ71F56 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
MED13LQ71F56 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
MED13LQ71F56 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
MED13LQ71F56 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
MED13LQ71F56 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
MED13LQ71F56 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
MED13LQ71F56 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
MED13LQ71F56 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
MED13LQ71F56 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
MED13LQ71F56 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
MED13LQ71F56 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
MED13LQ71F56 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
MED13LQ71F56 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
MED13LQ71F56 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
MED13LQ71F56 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
MED13LQ71F56 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
MED13LQ71F56 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
MED13LQ71F56 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
MED13LQ71F56 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
MED13LQ71F56 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
MED13LQ71F56 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
MED13LQ71F56 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
MED13LQ71F56 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
MED13LQ71F56 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
MED13LQ71F56 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
MED13LQ71F56 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
MED13LQ71F56 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
MED13LQ71F56 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
MED13LQ71F56 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
MED13LQ71F56 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
MED13LQ71F56 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
MED13LQ71F56 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
MED13LQ71F56 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
MED13LQ71F56 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
MED13LQ71F56 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
MED13LQ71F56 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms