Protein–RNA interactions for Protein: Q70CQ4

USP31, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 31, humanhuman

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Length 1,352 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP31Q70CQ4 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
USP31Q70CQ4 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
USP31Q70CQ4 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
USP31Q70CQ4 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
USP31Q70CQ4 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
USP31Q70CQ4 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
USP31Q70CQ4 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
USP31Q70CQ4 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC24.8■■□□□ 1.56
USP31Q70CQ4 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
USP31Q70CQ4 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
USP31Q70CQ4 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
USP31Q70CQ4 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
USP31Q70CQ4 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
USP31Q70CQ4 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
USP31Q70CQ4 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
USP31Q70CQ4 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
USP31Q70CQ4 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
USP31Q70CQ4 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
USP31Q70CQ4 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
USP31Q70CQ4 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
USP31Q70CQ4 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
USP31Q70CQ4 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
USP31Q70CQ4 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
USP31Q70CQ4 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
USP31Q70CQ4 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
USP31Q70CQ4 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC24.79■■□□□ 1.56
USP31Q70CQ4 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
USP31Q70CQ4 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
USP31Q70CQ4 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
USP31Q70CQ4 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
USP31Q70CQ4 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
USP31Q70CQ4 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
USP31Q70CQ4 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
USP31Q70CQ4 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
USP31Q70CQ4 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
USP31Q70CQ4 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
USP31Q70CQ4 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
USP31Q70CQ4 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
USP31Q70CQ4 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
USP31Q70CQ4 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
USP31Q70CQ4 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
USP31Q70CQ4 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
USP31Q70CQ4 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
USP31Q70CQ4 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
USP31Q70CQ4 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
USP31Q70CQ4 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
USP31Q70CQ4 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
USP31Q70CQ4 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
USP31Q70CQ4 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
USP31Q70CQ4 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
USP31Q70CQ4 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
USP31Q70CQ4 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
USP31Q70CQ4 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
USP31Q70CQ4 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
USP31Q70CQ4 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
USP31Q70CQ4 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
USP31Q70CQ4 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
USP31Q70CQ4 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
USP31Q70CQ4 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
USP31Q70CQ4 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
USP31Q70CQ4 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
USP31Q70CQ4 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
USP31Q70CQ4 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
USP31Q70CQ4 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
USP31Q70CQ4 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
USP31Q70CQ4 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
USP31Q70CQ4 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
USP31Q70CQ4 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
USP31Q70CQ4 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
USP31Q70CQ4 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
USP31Q70CQ4 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
USP31Q70CQ4 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
USP31Q70CQ4 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
USP31Q70CQ4 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
USP31Q70CQ4 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
USP31Q70CQ4 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
USP31Q70CQ4 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
USP31Q70CQ4 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
USP31Q70CQ4 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
USP31Q70CQ4 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
USP31Q70CQ4 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
USP31Q70CQ4 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
USP31Q70CQ4 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
USP31Q70CQ4 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
USP31Q70CQ4 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
USP31Q70CQ4 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
USP31Q70CQ4 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
USP31Q70CQ4 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
USP31Q70CQ4 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
USP31Q70CQ4 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
USP31Q70CQ4 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
USP31Q70CQ4 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
USP31Q70CQ4 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
USP31Q70CQ4 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
USP31Q70CQ4 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
USP31Q70CQ4 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
USP31Q70CQ4 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
USP31Q70CQ4 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
USP31Q70CQ4 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
USP31Q70CQ4 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
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