Protein–RNA interactions for Protein: Q70CQ2

USP34, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 34, humanhuman

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Length 3,546 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP34Q70CQ2 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
USP34Q70CQ2 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
USP34Q70CQ2 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
USP34Q70CQ2 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
USP34Q70CQ2 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
USP34Q70CQ2 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
USP34Q70CQ2 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
USP34Q70CQ2 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
USP34Q70CQ2 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
USP34Q70CQ2 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
USP34Q70CQ2 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
USP34Q70CQ2 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
USP34Q70CQ2 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
USP34Q70CQ2 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
USP34Q70CQ2 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
USP34Q70CQ2 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
USP34Q70CQ2 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
USP34Q70CQ2 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
USP34Q70CQ2 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
USP34Q70CQ2 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
USP34Q70CQ2 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
USP34Q70CQ2 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
USP34Q70CQ2 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
USP34Q70CQ2 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
USP34Q70CQ2 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
USP34Q70CQ2 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
USP34Q70CQ2 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
USP34Q70CQ2 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
USP34Q70CQ2 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
USP34Q70CQ2 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
USP34Q70CQ2 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
USP34Q70CQ2 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
USP34Q70CQ2 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
USP34Q70CQ2 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
USP34Q70CQ2 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
USP34Q70CQ2 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
USP34Q70CQ2 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
USP34Q70CQ2 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
USP34Q70CQ2 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
USP34Q70CQ2 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
USP34Q70CQ2 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
USP34Q70CQ2 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
USP34Q70CQ2 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
USP34Q70CQ2 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
USP34Q70CQ2 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
USP34Q70CQ2 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
USP34Q70CQ2 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
USP34Q70CQ2 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
USP34Q70CQ2 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
USP34Q70CQ2 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
USP34Q70CQ2 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
USP34Q70CQ2 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
USP34Q70CQ2 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
USP34Q70CQ2 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
USP34Q70CQ2 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
USP34Q70CQ2 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
USP34Q70CQ2 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
USP34Q70CQ2 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
USP34Q70CQ2 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
USP34Q70CQ2 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
USP34Q70CQ2 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
USP34Q70CQ2 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
USP34Q70CQ2 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
USP34Q70CQ2 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
USP34Q70CQ2 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
USP34Q70CQ2 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
USP34Q70CQ2 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
USP34Q70CQ2 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
USP34Q70CQ2 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
USP34Q70CQ2 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
USP34Q70CQ2 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
USP34Q70CQ2 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
USP34Q70CQ2 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
USP34Q70CQ2 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
USP34Q70CQ2 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
USP34Q70CQ2 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
USP34Q70CQ2 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
USP34Q70CQ2 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
USP34Q70CQ2 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
USP34Q70CQ2 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
USP34Q70CQ2 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
USP34Q70CQ2 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
USP34Q70CQ2 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
USP34Q70CQ2 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
USP34Q70CQ2 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
USP34Q70CQ2 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
USP34Q70CQ2 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
USP34Q70CQ2 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
USP34Q70CQ2 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
USP34Q70CQ2 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
USP34Q70CQ2 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
USP34Q70CQ2 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
USP34Q70CQ2 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
USP34Q70CQ2 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
USP34Q70CQ2 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
USP34Q70CQ2 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
USP34Q70CQ2 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
USP34Q70CQ2 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
USP34Q70CQ2 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
USP34Q70CQ2 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
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