Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZW31

SYDE1, Rho GTPase-activating protein SYDE1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 735 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYDE1Q6ZW31 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SYDE1Q6ZW31 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SYDE1Q6ZW31 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
SYDE1Q6ZW31 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SYDE1Q6ZW31 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SYDE1Q6ZW31 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SYDE1Q6ZW31 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SYDE1Q6ZW31 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SYDE1Q6ZW31 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
SYDE1Q6ZW31 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SYDE1Q6ZW31 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SYDE1Q6ZW31 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SYDE1Q6ZW31 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SYDE1Q6ZW31 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SYDE1Q6ZW31 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SYDE1Q6ZW31 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SYDE1Q6ZW31 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SYDE1Q6ZW31 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SYDE1Q6ZW31 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SYDE1Q6ZW31 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SYDE1Q6ZW31 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SYDE1Q6ZW31 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SYDE1Q6ZW31 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SYDE1Q6ZW31 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SYDE1Q6ZW31 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SYDE1Q6ZW31 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SYDE1Q6ZW31 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SYDE1Q6ZW31 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SYDE1Q6ZW31 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SYDE1Q6ZW31 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SYDE1Q6ZW31 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SYDE1Q6ZW31 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SYDE1Q6ZW31 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SYDE1Q6ZW31 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SYDE1Q6ZW31 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SYDE1Q6ZW31 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SYDE1Q6ZW31 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
SYDE1Q6ZW31 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SYDE1Q6ZW31 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SYDE1Q6ZW31 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SYDE1Q6ZW31 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SYDE1Q6ZW31 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SYDE1Q6ZW31 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SYDE1Q6ZW31 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SYDE1Q6ZW31 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SYDE1Q6ZW31 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SYDE1Q6ZW31 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SYDE1Q6ZW31 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SYDE1Q6ZW31 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SYDE1Q6ZW31 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SYDE1Q6ZW31 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SYDE1Q6ZW31 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SYDE1Q6ZW31 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SYDE1Q6ZW31 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SYDE1Q6ZW31 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SYDE1Q6ZW31 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SYDE1Q6ZW31 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SYDE1Q6ZW31 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SYDE1Q6ZW31 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SYDE1Q6ZW31 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SYDE1Q6ZW31 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SYDE1Q6ZW31 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SYDE1Q6ZW31 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SYDE1Q6ZW31 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SYDE1Q6ZW31 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SYDE1Q6ZW31 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SYDE1Q6ZW31 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SYDE1Q6ZW31 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SYDE1Q6ZW31 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SYDE1Q6ZW31 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SYDE1Q6ZW31 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SYDE1Q6ZW31 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
SYDE1Q6ZW31 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SYDE1Q6ZW31 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SYDE1Q6ZW31 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SYDE1Q6ZW31 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SYDE1Q6ZW31 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SYDE1Q6ZW31 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SYDE1Q6ZW31 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SYDE1Q6ZW31 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SYDE1Q6ZW31 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SYDE1Q6ZW31 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SYDE1Q6ZW31 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SYDE1Q6ZW31 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SYDE1Q6ZW31 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SYDE1Q6ZW31 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SYDE1Q6ZW31 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SYDE1Q6ZW31 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SYDE1Q6ZW31 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SYDE1Q6ZW31 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SYDE1Q6ZW31 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SYDE1Q6ZW31 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SYDE1Q6ZW31 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SYDE1Q6ZW31 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
SYDE1Q6ZW31 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
SYDE1Q6ZW31 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
SYDE1Q6ZW31 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
SYDE1Q6ZW31 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
SYDE1Q6ZW31 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SYDE1Q6ZW31 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.9 ms