Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZV60

LINC00173, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00173, humanhuman

Predictions only

Length 143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00173Q6ZV60 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
LINC00173Q6ZV60 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
LINC00173Q6ZV60 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
LINC00173Q6ZV60 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
LINC00173Q6ZV60 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
LINC00173Q6ZV60 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
LINC00173Q6ZV60 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
LINC00173Q6ZV60 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
LINC00173Q6ZV60 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
LINC00173Q6ZV60 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
LINC00173Q6ZV60 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
LINC00173Q6ZV60 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
LINC00173Q6ZV60 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LINC00173Q6ZV60 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
LINC00173Q6ZV60 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LINC00173Q6ZV60 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
LINC00173Q6ZV60 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
LINC00173Q6ZV60 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
LINC00173Q6ZV60 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LINC00173Q6ZV60 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LINC00173Q6ZV60 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
LINC00173Q6ZV60 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
LINC00173Q6ZV60 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
LINC00173Q6ZV60 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LINC00173Q6ZV60 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
LINC00173Q6ZV60 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
LINC00173Q6ZV60 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LINC00173Q6ZV60 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
LINC00173Q6ZV60 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LINC00173Q6ZV60 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LINC00173Q6ZV60 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LINC00173Q6ZV60 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
LINC00173Q6ZV60 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
LINC00173Q6ZV60 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
LINC00173Q6ZV60 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LINC00173Q6ZV60 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LINC00173Q6ZV60 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
LINC00173Q6ZV60 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
LINC00173Q6ZV60 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LINC00173Q6ZV60 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
LINC00173Q6ZV60 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LINC00173Q6ZV60 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LINC00173Q6ZV60 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LINC00173Q6ZV60 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LINC00173Q6ZV60 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
LINC00173Q6ZV60 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LINC00173Q6ZV60 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LINC00173Q6ZV60 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LINC00173Q6ZV60 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
LINC00173Q6ZV60 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
LINC00173Q6ZV60 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LINC00173Q6ZV60 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
LINC00173Q6ZV60 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
LINC00173Q6ZV60 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LINC00173Q6ZV60 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
LINC00173Q6ZV60 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
LINC00173Q6ZV60 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
LINC00173Q6ZV60 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
LINC00173Q6ZV60 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LINC00173Q6ZV60 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LINC00173Q6ZV60 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
LINC00173Q6ZV60 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
LINC00173Q6ZV60 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LINC00173Q6ZV60 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LINC00173Q6ZV60 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LINC00173Q6ZV60 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LINC00173Q6ZV60 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LINC00173Q6ZV60 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
LINC00173Q6ZV60 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LINC00173Q6ZV60 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LINC00173Q6ZV60 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LINC00173Q6ZV60 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
LINC00173Q6ZV60 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LINC00173Q6ZV60 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LINC00173Q6ZV60 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LINC00173Q6ZV60 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LINC00173Q6ZV60 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
LINC00173Q6ZV60 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LINC00173Q6ZV60 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
LINC00173Q6ZV60 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
LINC00173Q6ZV60 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LINC00173Q6ZV60 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
LINC00173Q6ZV60 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
LINC00173Q6ZV60 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LINC00173Q6ZV60 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
LINC00173Q6ZV60 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LINC00173Q6ZV60 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LINC00173Q6ZV60 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
LINC00173Q6ZV60 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LINC00173Q6ZV60 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
LINC00173Q6ZV60 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LINC00173Q6ZV60 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LINC00173Q6ZV60 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LINC00173Q6ZV60 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LINC00173Q6ZV60 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
LINC00173Q6ZV60 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LINC00173Q6ZV60 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LINC00173Q6ZV60 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
LINC00173Q6ZV60 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LINC00173Q6ZV60 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.2 ms