Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMZ3

SYNE3, Nesprin-3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNE3Q6ZMZ3 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SYNE3Q6ZMZ3 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SYNE3Q6ZMZ3 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SYNE3Q6ZMZ3 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SYNE3Q6ZMZ3 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SYNE3Q6ZMZ3 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SYNE3Q6ZMZ3 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SYNE3Q6ZMZ3 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SYNE3Q6ZMZ3 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
SYNE3Q6ZMZ3 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
SYNE3Q6ZMZ3 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SYNE3Q6ZMZ3 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SYNE3Q6ZMZ3 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SYNE3Q6ZMZ3 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SYNE3Q6ZMZ3 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SYNE3Q6ZMZ3 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
SYNE3Q6ZMZ3 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SYNE3Q6ZMZ3 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SYNE3Q6ZMZ3 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SYNE3Q6ZMZ3 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SYNE3Q6ZMZ3 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SYNE3Q6ZMZ3 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SYNE3Q6ZMZ3 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SYNE3Q6ZMZ3 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SYNE3Q6ZMZ3 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SYNE3Q6ZMZ3 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SYNE3Q6ZMZ3 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SYNE3Q6ZMZ3 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SYNE3Q6ZMZ3 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SYNE3Q6ZMZ3 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SYNE3Q6ZMZ3 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SYNE3Q6ZMZ3 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SYNE3Q6ZMZ3 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SYNE3Q6ZMZ3 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SYNE3Q6ZMZ3 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SYNE3Q6ZMZ3 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SYNE3Q6ZMZ3 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SYNE3Q6ZMZ3 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SYNE3Q6ZMZ3 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SYNE3Q6ZMZ3 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SYNE3Q6ZMZ3 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SYNE3Q6ZMZ3 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SYNE3Q6ZMZ3 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SYNE3Q6ZMZ3 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SYNE3Q6ZMZ3 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SYNE3Q6ZMZ3 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SYNE3Q6ZMZ3 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SYNE3Q6ZMZ3 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SYNE3Q6ZMZ3 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SYNE3Q6ZMZ3 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SYNE3Q6ZMZ3 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SYNE3Q6ZMZ3 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SYNE3Q6ZMZ3 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SYNE3Q6ZMZ3 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SYNE3Q6ZMZ3 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SYNE3Q6ZMZ3 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SYNE3Q6ZMZ3 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SYNE3Q6ZMZ3 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SYNE3Q6ZMZ3 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SYNE3Q6ZMZ3 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SYNE3Q6ZMZ3 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SYNE3Q6ZMZ3 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SYNE3Q6ZMZ3 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
SYNE3Q6ZMZ3 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SYNE3Q6ZMZ3 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SYNE3Q6ZMZ3 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
SYNE3Q6ZMZ3 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
SYNE3Q6ZMZ3 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SYNE3Q6ZMZ3 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SYNE3Q6ZMZ3 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SYNE3Q6ZMZ3 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SYNE3Q6ZMZ3 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SYNE3Q6ZMZ3 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SYNE3Q6ZMZ3 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SYNE3Q6ZMZ3 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SYNE3Q6ZMZ3 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SYNE3Q6ZMZ3 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SYNE3Q6ZMZ3 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SYNE3Q6ZMZ3 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SYNE3Q6ZMZ3 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SYNE3Q6ZMZ3 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SYNE3Q6ZMZ3 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SYNE3Q6ZMZ3 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SYNE3Q6ZMZ3 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SYNE3Q6ZMZ3 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
SYNE3Q6ZMZ3 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SYNE3Q6ZMZ3 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
SYNE3Q6ZMZ3 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SYNE3Q6ZMZ3 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SYNE3Q6ZMZ3 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SYNE3Q6ZMZ3 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SYNE3Q6ZMZ3 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SYNE3Q6ZMZ3 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SYNE3Q6ZMZ3 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SYNE3Q6ZMZ3 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SYNE3Q6ZMZ3 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SYNE3Q6ZMZ3 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SYNE3Q6ZMZ3 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SYNE3Q6ZMZ3 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SYNE3Q6ZMZ3 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
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