Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXZ0

TMIGD1, Transmembrane and immunoglobulin domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 262 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIGD1Q6UXZ0 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TMIGD1Q6UXZ0 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TMIGD1Q6UXZ0 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TMIGD1Q6UXZ0 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TMIGD1Q6UXZ0 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TMIGD1Q6UXZ0 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TMIGD1Q6UXZ0 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TMIGD1Q6UXZ0 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TMIGD1Q6UXZ0 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TMIGD1Q6UXZ0 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TMIGD1Q6UXZ0 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TMIGD1Q6UXZ0 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TMIGD1Q6UXZ0 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TMIGD1Q6UXZ0 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TMIGD1Q6UXZ0 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMIGD1Q6UXZ0 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMIGD1Q6UXZ0 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMIGD1Q6UXZ0 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMIGD1Q6UXZ0 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMIGD1Q6UXZ0 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMIGD1Q6UXZ0 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMIGD1Q6UXZ0 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMIGD1Q6UXZ0 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMIGD1Q6UXZ0 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMIGD1Q6UXZ0 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMIGD1Q6UXZ0 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMIGD1Q6UXZ0 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
TMIGD1Q6UXZ0 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
TMIGD1Q6UXZ0 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMIGD1Q6UXZ0 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMIGD1Q6UXZ0 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMIGD1Q6UXZ0 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMIGD1Q6UXZ0 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
TMIGD1Q6UXZ0 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMIGD1Q6UXZ0 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMIGD1Q6UXZ0 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMIGD1Q6UXZ0 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMIGD1Q6UXZ0 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMIGD1Q6UXZ0 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMIGD1Q6UXZ0 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMIGD1Q6UXZ0 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMIGD1Q6UXZ0 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMIGD1Q6UXZ0 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMIGD1Q6UXZ0 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMIGD1Q6UXZ0 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMIGD1Q6UXZ0 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMIGD1Q6UXZ0 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMIGD1Q6UXZ0 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMIGD1Q6UXZ0 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMIGD1Q6UXZ0 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMIGD1Q6UXZ0 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMIGD1Q6UXZ0 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMIGD1Q6UXZ0 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMIGD1Q6UXZ0 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMIGD1Q6UXZ0 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMIGD1Q6UXZ0 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMIGD1Q6UXZ0 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMIGD1Q6UXZ0 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMIGD1Q6UXZ0 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMIGD1Q6UXZ0 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMIGD1Q6UXZ0 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TMIGD1Q6UXZ0 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TMIGD1Q6UXZ0 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TMIGD1Q6UXZ0 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TMIGD1Q6UXZ0 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TMIGD1Q6UXZ0 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TMIGD1Q6UXZ0 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TMIGD1Q6UXZ0 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TMIGD1Q6UXZ0 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TMIGD1Q6UXZ0 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TMIGD1Q6UXZ0 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TMIGD1Q6UXZ0 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TMIGD1Q6UXZ0 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TMIGD1Q6UXZ0 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TMIGD1Q6UXZ0 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TMIGD1Q6UXZ0 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TMIGD1Q6UXZ0 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TMIGD1Q6UXZ0 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TMIGD1Q6UXZ0 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TMIGD1Q6UXZ0 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TMIGD1Q6UXZ0 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TMIGD1Q6UXZ0 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TMIGD1Q6UXZ0 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TMIGD1Q6UXZ0 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TMIGD1Q6UXZ0 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TMIGD1Q6UXZ0 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TMIGD1Q6UXZ0 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
TMIGD1Q6UXZ0 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TMIGD1Q6UXZ0 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TMIGD1Q6UXZ0 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TMIGD1Q6UXZ0 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TMIGD1Q6UXZ0 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TMIGD1Q6UXZ0 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TMIGD1Q6UXZ0 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TMIGD1Q6UXZ0 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TMIGD1Q6UXZ0 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TMIGD1Q6UXZ0 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TMIGD1Q6UXZ0 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TMIGD1Q6UXZ0 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TMIGD1Q6UXZ0 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms