Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXD1

HRCT1, Histidine-rich carboxyl terminus protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 115 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HRCT1Q6UXD1 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
HRCT1Q6UXD1 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
HRCT1Q6UXD1 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
HRCT1Q6UXD1 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
HRCT1Q6UXD1 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
HRCT1Q6UXD1 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
HRCT1Q6UXD1 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
HRCT1Q6UXD1 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
HRCT1Q6UXD1 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
HRCT1Q6UXD1 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
HRCT1Q6UXD1 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
HRCT1Q6UXD1 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
HRCT1Q6UXD1 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
HRCT1Q6UXD1 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
HRCT1Q6UXD1 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
HRCT1Q6UXD1 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
HRCT1Q6UXD1 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
HRCT1Q6UXD1 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
HRCT1Q6UXD1 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
HRCT1Q6UXD1 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
HRCT1Q6UXD1 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
HRCT1Q6UXD1 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
HRCT1Q6UXD1 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
HRCT1Q6UXD1 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
HRCT1Q6UXD1 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
HRCT1Q6UXD1 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
HRCT1Q6UXD1 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
HRCT1Q6UXD1 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
HRCT1Q6UXD1 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
HRCT1Q6UXD1 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
HRCT1Q6UXD1 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
HRCT1Q6UXD1 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
HRCT1Q6UXD1 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
HRCT1Q6UXD1 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
HRCT1Q6UXD1 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
HRCT1Q6UXD1 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
HRCT1Q6UXD1 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
HRCT1Q6UXD1 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
HRCT1Q6UXD1 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
HRCT1Q6UXD1 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
HRCT1Q6UXD1 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
HRCT1Q6UXD1 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
HRCT1Q6UXD1 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
HRCT1Q6UXD1 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
HRCT1Q6UXD1 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
HRCT1Q6UXD1 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
HRCT1Q6UXD1 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
HRCT1Q6UXD1 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
HRCT1Q6UXD1 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
HRCT1Q6UXD1 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
HRCT1Q6UXD1 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
HRCT1Q6UXD1 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
HRCT1Q6UXD1 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
HRCT1Q6UXD1 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
HRCT1Q6UXD1 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
HRCT1Q6UXD1 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
HRCT1Q6UXD1 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
HRCT1Q6UXD1 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
HRCT1Q6UXD1 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
HRCT1Q6UXD1 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
HRCT1Q6UXD1 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
HRCT1Q6UXD1 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
HRCT1Q6UXD1 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
HRCT1Q6UXD1 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
HRCT1Q6UXD1 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
HRCT1Q6UXD1 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
HRCT1Q6UXD1 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
HRCT1Q6UXD1 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
HRCT1Q6UXD1 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
HRCT1Q6UXD1 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
HRCT1Q6UXD1 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
HRCT1Q6UXD1 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
HRCT1Q6UXD1 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
HRCT1Q6UXD1 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
HRCT1Q6UXD1 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
HRCT1Q6UXD1 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
HRCT1Q6UXD1 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
HRCT1Q6UXD1 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
HRCT1Q6UXD1 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
HRCT1Q6UXD1 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC11.59□□□□□ -0.55
HRCT1Q6UXD1 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
HRCT1Q6UXD1 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
HRCT1Q6UXD1 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
HRCT1Q6UXD1 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
HRCT1Q6UXD1 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
HRCT1Q6UXD1 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
HRCT1Q6UXD1 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
HRCT1Q6UXD1 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
HRCT1Q6UXD1 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
HRCT1Q6UXD1 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
HRCT1Q6UXD1 DENND4C-209ENST00000602925 6831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
HRCT1Q6UXD1 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
HRCT1Q6UXD1 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
HRCT1Q6UXD1 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
HRCT1Q6UXD1 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
HRCT1Q6UXD1 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
HRCT1Q6UXD1 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
HRCT1Q6UXD1 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
HRCT1Q6UXD1 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
HRCT1Q6UXD1 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms