Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWL2

SUSD1, Sushi domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUSD1Q6UWL2 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SUSD1Q6UWL2 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SUSD1Q6UWL2 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SUSD1Q6UWL2 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SUSD1Q6UWL2 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SUSD1Q6UWL2 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SUSD1Q6UWL2 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SUSD1Q6UWL2 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SUSD1Q6UWL2 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SUSD1Q6UWL2 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SUSD1Q6UWL2 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SUSD1Q6UWL2 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SUSD1Q6UWL2 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SUSD1Q6UWL2 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SUSD1Q6UWL2 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SUSD1Q6UWL2 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SUSD1Q6UWL2 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SUSD1Q6UWL2 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SUSD1Q6UWL2 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SUSD1Q6UWL2 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SUSD1Q6UWL2 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SUSD1Q6UWL2 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SUSD1Q6UWL2 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SUSD1Q6UWL2 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SUSD1Q6UWL2 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
SUSD1Q6UWL2 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SUSD1Q6UWL2 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SUSD1Q6UWL2 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
SUSD1Q6UWL2 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SUSD1Q6UWL2 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SUSD1Q6UWL2 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SUSD1Q6UWL2 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SUSD1Q6UWL2 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SUSD1Q6UWL2 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SUSD1Q6UWL2 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SUSD1Q6UWL2 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SUSD1Q6UWL2 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SUSD1Q6UWL2 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SUSD1Q6UWL2 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SUSD1Q6UWL2 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SUSD1Q6UWL2 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SUSD1Q6UWL2 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SUSD1Q6UWL2 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SUSD1Q6UWL2 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SUSD1Q6UWL2 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SUSD1Q6UWL2 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SUSD1Q6UWL2 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SUSD1Q6UWL2 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SUSD1Q6UWL2 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SUSD1Q6UWL2 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SUSD1Q6UWL2 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SUSD1Q6UWL2 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SUSD1Q6UWL2 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SUSD1Q6UWL2 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SUSD1Q6UWL2 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SUSD1Q6UWL2 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SUSD1Q6UWL2 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SUSD1Q6UWL2 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SUSD1Q6UWL2 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SUSD1Q6UWL2 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SUSD1Q6UWL2 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SUSD1Q6UWL2 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SUSD1Q6UWL2 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SUSD1Q6UWL2 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SUSD1Q6UWL2 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SUSD1Q6UWL2 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SUSD1Q6UWL2 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SUSD1Q6UWL2 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SUSD1Q6UWL2 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SUSD1Q6UWL2 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SUSD1Q6UWL2 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SUSD1Q6UWL2 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SUSD1Q6UWL2 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SUSD1Q6UWL2 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SUSD1Q6UWL2 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SUSD1Q6UWL2 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SUSD1Q6UWL2 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SUSD1Q6UWL2 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SUSD1Q6UWL2 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SUSD1Q6UWL2 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SUSD1Q6UWL2 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SUSD1Q6UWL2 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SUSD1Q6UWL2 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SUSD1Q6UWL2 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SUSD1Q6UWL2 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SUSD1Q6UWL2 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SUSD1Q6UWL2 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SUSD1Q6UWL2 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SUSD1Q6UWL2 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SUSD1Q6UWL2 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SUSD1Q6UWL2 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SUSD1Q6UWL2 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SUSD1Q6UWL2 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SUSD1Q6UWL2 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SUSD1Q6UWL2 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SUSD1Q6UWL2 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SUSD1Q6UWL2 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SUSD1Q6UWL2 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SUSD1Q6UWL2 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SUSD1Q6UWL2 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms