Protein–RNA interactions for Protein: Q6SA08

TSSK4, Testis-specific serine/threonine-protein kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSSK4Q6SA08 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TSSK4Q6SA08 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TSSK4Q6SA08 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TSSK4Q6SA08 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TSSK4Q6SA08 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TSSK4Q6SA08 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TSSK4Q6SA08 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TSSK4Q6SA08 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TSSK4Q6SA08 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TSSK4Q6SA08 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TSSK4Q6SA08 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TSSK4Q6SA08 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TSSK4Q6SA08 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TSSK4Q6SA08 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TSSK4Q6SA08 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TSSK4Q6SA08 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TSSK4Q6SA08 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TSSK4Q6SA08 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
TSSK4Q6SA08 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TSSK4Q6SA08 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TSSK4Q6SA08 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TSSK4Q6SA08 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TSSK4Q6SA08 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TSSK4Q6SA08 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
TSSK4Q6SA08 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TSSK4Q6SA08 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TSSK4Q6SA08 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TSSK4Q6SA08 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TSSK4Q6SA08 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TSSK4Q6SA08 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TSSK4Q6SA08 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TSSK4Q6SA08 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TSSK4Q6SA08 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TSSK4Q6SA08 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TSSK4Q6SA08 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TSSK4Q6SA08 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TSSK4Q6SA08 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TSSK4Q6SA08 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TSSK4Q6SA08 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TSSK4Q6SA08 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
TSSK4Q6SA08 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TSSK4Q6SA08 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TSSK4Q6SA08 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TSSK4Q6SA08 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
TSSK4Q6SA08 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TSSK4Q6SA08 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
TSSK4Q6SA08 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TSSK4Q6SA08 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TSSK4Q6SA08 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TSSK4Q6SA08 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TSSK4Q6SA08 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TSSK4Q6SA08 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TSSK4Q6SA08 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TSSK4Q6SA08 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TSSK4Q6SA08 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TSSK4Q6SA08 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TSSK4Q6SA08 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TSSK4Q6SA08 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TSSK4Q6SA08 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
TSSK4Q6SA08 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TSSK4Q6SA08 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
TSSK4Q6SA08 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TSSK4Q6SA08 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TSSK4Q6SA08 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TSSK4Q6SA08 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
TSSK4Q6SA08 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TSSK4Q6SA08 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TSSK4Q6SA08 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TSSK4Q6SA08 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TSSK4Q6SA08 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
TSSK4Q6SA08 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TSSK4Q6SA08 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TSSK4Q6SA08 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TSSK4Q6SA08 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TSSK4Q6SA08 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TSSK4Q6SA08 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TSSK4Q6SA08 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TSSK4Q6SA08 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TSSK4Q6SA08 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TSSK4Q6SA08 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TSSK4Q6SA08 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TSSK4Q6SA08 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TSSK4Q6SA08 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TSSK4Q6SA08 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
TSSK4Q6SA08 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TSSK4Q6SA08 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TSSK4Q6SA08 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
TSSK4Q6SA08 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TSSK4Q6SA08 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TSSK4Q6SA08 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TSSK4Q6SA08 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TSSK4Q6SA08 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TSSK4Q6SA08 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TSSK4Q6SA08 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TSSK4Q6SA08 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TSSK4Q6SA08 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TSSK4Q6SA08 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TSSK4Q6SA08 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TSSK4Q6SA08 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TSSK4Q6SA08 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms