Protein–RNA interactions for Protein: Q6P435

Putative uncharacterized SMG1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q6P435 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q6P435 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q6P435 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q6P435 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q6P435 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q6P435 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q6P435 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q6P435 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q6P435 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q6P435 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Q6P435 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q6P435 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q6P435 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q6P435 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q6P435 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q6P435 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q6P435 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q6P435 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q6P435 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q6P435 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q6P435 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q6P435 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q6P435 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q6P435 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q6P435 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q6P435 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q6P435 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q6P435 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Q6P435 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q6P435 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q6P435 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q6P435 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q6P435 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Q6P435 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Q6P435 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Q6P435 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Q6P435 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Q6P435 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Q6P435 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Q6P435 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Q6P435 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Q6P435 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Q6P435 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Q6P435 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Q6P435 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Q6P435 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Q6P435 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Q6P435 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q6P435 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q6P435 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q6P435 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q6P435 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q6P435 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q6P435 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Q6P435 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q6P435 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q6P435 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q6P435 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q6P435 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q6P435 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q6P435 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q6P435 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q6P435 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Q6P435 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q6P435 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q6P435 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Q6P435 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q6P435 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q6P435 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q6P435 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q6P435 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q6P435 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q6P435 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q6P435 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q6P435 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q6P435 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q6P435 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q6P435 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q6P435 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Q6P435 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q6P435 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Q6P435 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q6P435 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q6P435 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q6P435 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q6P435 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q6P435 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q6P435 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q6P435 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Q6P435 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q6P435 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q6P435 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Q6P435 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Q6P435 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q6P435 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q6P435 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Q6P435 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q6P435 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Q6P435 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Q6P435 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.4 ms