Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZI2

CAVIN1, Caveolae-associated protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAVIN1Q6NZI2 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CAVIN1Q6NZI2 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CAVIN1Q6NZI2 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CAVIN1Q6NZI2 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CAVIN1Q6NZI2 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CAVIN1Q6NZI2 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CAVIN1Q6NZI2 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CAVIN1Q6NZI2 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CAVIN1Q6NZI2 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CAVIN1Q6NZI2 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
CAVIN1Q6NZI2 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
CAVIN1Q6NZI2 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CAVIN1Q6NZI2 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CAVIN1Q6NZI2 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CAVIN1Q6NZI2 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CAVIN1Q6NZI2 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CAVIN1Q6NZI2 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CAVIN1Q6NZI2 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CAVIN1Q6NZI2 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CAVIN1Q6NZI2 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CAVIN1Q6NZI2 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CAVIN1Q6NZI2 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CAVIN1Q6NZI2 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CAVIN1Q6NZI2 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CAVIN1Q6NZI2 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CAVIN1Q6NZI2 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CAVIN1Q6NZI2 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CAVIN1Q6NZI2 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CAVIN1Q6NZI2 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CAVIN1Q6NZI2 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CAVIN1Q6NZI2 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CAVIN1Q6NZI2 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
CAVIN1Q6NZI2 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CAVIN1Q6NZI2 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CAVIN1Q6NZI2 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CAVIN1Q6NZI2 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CAVIN1Q6NZI2 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CAVIN1Q6NZI2 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
CAVIN1Q6NZI2 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CAVIN1Q6NZI2 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CAVIN1Q6NZI2 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CAVIN1Q6NZI2 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CAVIN1Q6NZI2 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CAVIN1Q6NZI2 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CAVIN1Q6NZI2 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CAVIN1Q6NZI2 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CAVIN1Q6NZI2 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CAVIN1Q6NZI2 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CAVIN1Q6NZI2 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CAVIN1Q6NZI2 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CAVIN1Q6NZI2 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CAVIN1Q6NZI2 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CAVIN1Q6NZI2 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CAVIN1Q6NZI2 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CAVIN1Q6NZI2 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CAVIN1Q6NZI2 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CAVIN1Q6NZI2 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CAVIN1Q6NZI2 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CAVIN1Q6NZI2 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CAVIN1Q6NZI2 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CAVIN1Q6NZI2 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CAVIN1Q6NZI2 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CAVIN1Q6NZI2 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CAVIN1Q6NZI2 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CAVIN1Q6NZI2 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CAVIN1Q6NZI2 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CAVIN1Q6NZI2 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CAVIN1Q6NZI2 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CAVIN1Q6NZI2 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CAVIN1Q6NZI2 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CAVIN1Q6NZI2 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CAVIN1Q6NZI2 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CAVIN1Q6NZI2 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CAVIN1Q6NZI2 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CAVIN1Q6NZI2 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CAVIN1Q6NZI2 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CAVIN1Q6NZI2 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CAVIN1Q6NZI2 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CAVIN1Q6NZI2 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CAVIN1Q6NZI2 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CAVIN1Q6NZI2 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CAVIN1Q6NZI2 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
CAVIN1Q6NZI2 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CAVIN1Q6NZI2 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CAVIN1Q6NZI2 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CAVIN1Q6NZI2 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CAVIN1Q6NZI2 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CAVIN1Q6NZI2 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
CAVIN1Q6NZI2 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CAVIN1Q6NZI2 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
CAVIN1Q6NZI2 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
CAVIN1Q6NZI2 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
CAVIN1Q6NZI2 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CAVIN1Q6NZI2 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CAVIN1Q6NZI2 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CAVIN1Q6NZI2 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CAVIN1Q6NZI2 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CAVIN1Q6NZI2 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CAVIN1Q6NZI2 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CAVIN1Q6NZI2 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 106.3 ms