Protein–RNA interactions for Protein: Q6NUI1

CCDC144NL, Putative coiled-coil domain-containing protein 144 N-terminal-like, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC144NLQ6NUI1 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC144NLQ6NUI1 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC144NLQ6NUI1 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC144NLQ6NUI1 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC144NLQ6NUI1 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC144NLQ6NUI1 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC144NLQ6NUI1 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CCDC144NLQ6NUI1 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC144NLQ6NUI1 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC144NLQ6NUI1 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CCDC144NLQ6NUI1 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
CCDC144NLQ6NUI1 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CCDC144NLQ6NUI1 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CCDC144NLQ6NUI1 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
CCDC144NLQ6NUI1 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CCDC144NLQ6NUI1 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CCDC144NLQ6NUI1 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CCDC144NLQ6NUI1 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CCDC144NLQ6NUI1 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CCDC144NLQ6NUI1 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CCDC144NLQ6NUI1 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CCDC144NLQ6NUI1 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CCDC144NLQ6NUI1 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CCDC144NLQ6NUI1 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
CCDC144NLQ6NUI1 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CCDC144NLQ6NUI1 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
CCDC144NLQ6NUI1 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
CCDC144NLQ6NUI1 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CCDC144NLQ6NUI1 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CCDC144NLQ6NUI1 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CCDC144NLQ6NUI1 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CCDC144NLQ6NUI1 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CCDC144NLQ6NUI1 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CCDC144NLQ6NUI1 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CCDC144NLQ6NUI1 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
CCDC144NLQ6NUI1 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CCDC144NLQ6NUI1 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CCDC144NLQ6NUI1 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CCDC144NLQ6NUI1 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CCDC144NLQ6NUI1 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CCDC144NLQ6NUI1 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CCDC144NLQ6NUI1 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CCDC144NLQ6NUI1 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CCDC144NLQ6NUI1 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
CCDC144NLQ6NUI1 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CCDC144NLQ6NUI1 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC144NLQ6NUI1 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC144NLQ6NUI1 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC144NLQ6NUI1 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC144NLQ6NUI1 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC144NLQ6NUI1 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC144NLQ6NUI1 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC144NLQ6NUI1 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC144NLQ6NUI1 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC144NLQ6NUI1 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC144NLQ6NUI1 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC144NLQ6NUI1 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC144NLQ6NUI1 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC144NLQ6NUI1 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC144NLQ6NUI1 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC144NLQ6NUI1 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC144NLQ6NUI1 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CCDC144NLQ6NUI1 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC144NLQ6NUI1 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC144NLQ6NUI1 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CCDC144NLQ6NUI1 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC144NLQ6NUI1 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC144NLQ6NUI1 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CCDC144NLQ6NUI1 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC144NLQ6NUI1 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC144NLQ6NUI1 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CCDC144NLQ6NUI1 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CCDC144NLQ6NUI1 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CCDC144NLQ6NUI1 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CCDC144NLQ6NUI1 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CCDC144NLQ6NUI1 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC144NLQ6NUI1 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC144NLQ6NUI1 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC144NLQ6NUI1 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CCDC144NLQ6NUI1 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC144NLQ6NUI1 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC144NLQ6NUI1 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC144NLQ6NUI1 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC144NLQ6NUI1 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CCDC144NLQ6NUI1 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC144NLQ6NUI1 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC144NLQ6NUI1 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC144NLQ6NUI1 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC144NLQ6NUI1 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC144NLQ6NUI1 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC144NLQ6NUI1 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC144NLQ6NUI1 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC144NLQ6NUI1 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC144NLQ6NUI1 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC144NLQ6NUI1 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC144NLQ6NUI1 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC144NLQ6NUI1 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC144NLQ6NUI1 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC144NLQ6NUI1 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CCDC144NLQ6NUI1 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms