Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWW1

C1QL3, Complement C1q-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1QL3Q5VWW1 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
C1QL3Q5VWW1 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
C1QL3Q5VWW1 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
C1QL3Q5VWW1 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
C1QL3Q5VWW1 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
C1QL3Q5VWW1 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
C1QL3Q5VWW1 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
C1QL3Q5VWW1 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
C1QL3Q5VWW1 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
C1QL3Q5VWW1 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
C1QL3Q5VWW1 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
C1QL3Q5VWW1 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
C1QL3Q5VWW1 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
C1QL3Q5VWW1 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
C1QL3Q5VWW1 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
C1QL3Q5VWW1 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
C1QL3Q5VWW1 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
C1QL3Q5VWW1 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
C1QL3Q5VWW1 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
C1QL3Q5VWW1 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
C1QL3Q5VWW1 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
C1QL3Q5VWW1 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
C1QL3Q5VWW1 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
C1QL3Q5VWW1 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
C1QL3Q5VWW1 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
C1QL3Q5VWW1 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
C1QL3Q5VWW1 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
C1QL3Q5VWW1 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
C1QL3Q5VWW1 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
C1QL3Q5VWW1 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
C1QL3Q5VWW1 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
C1QL3Q5VWW1 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
C1QL3Q5VWW1 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
C1QL3Q5VWW1 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
C1QL3Q5VWW1 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
C1QL3Q5VWW1 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
C1QL3Q5VWW1 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
C1QL3Q5VWW1 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
C1QL3Q5VWW1 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
C1QL3Q5VWW1 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
C1QL3Q5VWW1 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
C1QL3Q5VWW1 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
C1QL3Q5VWW1 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
C1QL3Q5VWW1 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
C1QL3Q5VWW1 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
C1QL3Q5VWW1 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
C1QL3Q5VWW1 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
C1QL3Q5VWW1 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
C1QL3Q5VWW1 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
C1QL3Q5VWW1 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
C1QL3Q5VWW1 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
C1QL3Q5VWW1 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
C1QL3Q5VWW1 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
C1QL3Q5VWW1 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
C1QL3Q5VWW1 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
C1QL3Q5VWW1 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
C1QL3Q5VWW1 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
C1QL3Q5VWW1 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
C1QL3Q5VWW1 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
C1QL3Q5VWW1 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
C1QL3Q5VWW1 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
C1QL3Q5VWW1 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
C1QL3Q5VWW1 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
C1QL3Q5VWW1 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
C1QL3Q5VWW1 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
C1QL3Q5VWW1 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
C1QL3Q5VWW1 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
C1QL3Q5VWW1 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
C1QL3Q5VWW1 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
C1QL3Q5VWW1 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
C1QL3Q5VWW1 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
C1QL3Q5VWW1 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
C1QL3Q5VWW1 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
C1QL3Q5VWW1 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
C1QL3Q5VWW1 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
C1QL3Q5VWW1 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
C1QL3Q5VWW1 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
C1QL3Q5VWW1 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
C1QL3Q5VWW1 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
C1QL3Q5VWW1 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
C1QL3Q5VWW1 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
C1QL3Q5VWW1 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
C1QL3Q5VWW1 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
C1QL3Q5VWW1 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
C1QL3Q5VWW1 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
C1QL3Q5VWW1 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
C1QL3Q5VWW1 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
C1QL3Q5VWW1 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
C1QL3Q5VWW1 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
C1QL3Q5VWW1 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
C1QL3Q5VWW1 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
C1QL3Q5VWW1 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
C1QL3Q5VWW1 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
C1QL3Q5VWW1 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
C1QL3Q5VWW1 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
C1QL3Q5VWW1 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
C1QL3Q5VWW1 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
C1QL3Q5VWW1 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
C1QL3Q5VWW1 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
C1QL3Q5VWW1 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.4 ms