Protein–RNA interactions for Protein: Q5SYE7

NHSL1, NHS-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,610 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHSL1Q5SYE7 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
NHSL1Q5SYE7 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
NHSL1Q5SYE7 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NHSL1Q5SYE7 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NHSL1Q5SYE7 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC25■■□□□ 1.59
NHSL1Q5SYE7 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
NHSL1Q5SYE7 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
NHSL1Q5SYE7 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NHSL1Q5SYE7 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NHSL1Q5SYE7 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NHSL1Q5SYE7 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
NHSL1Q5SYE7 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC25■■□□□ 1.59
NHSL1Q5SYE7 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
NHSL1Q5SYE7 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
NHSL1Q5SYE7 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
NHSL1Q5SYE7 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NHSL1Q5SYE7 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NHSL1Q5SYE7 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NHSL1Q5SYE7 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NHSL1Q5SYE7 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NHSL1Q5SYE7 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NHSL1Q5SYE7 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NHSL1Q5SYE7 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NHSL1Q5SYE7 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NHSL1Q5SYE7 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
NHSL1Q5SYE7 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NHSL1Q5SYE7 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NHSL1Q5SYE7 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NHSL1Q5SYE7 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NHSL1Q5SYE7 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NHSL1Q5SYE7 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NHSL1Q5SYE7 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NHSL1Q5SYE7 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NHSL1Q5SYE7 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NHSL1Q5SYE7 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
NHSL1Q5SYE7 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NHSL1Q5SYE7 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NHSL1Q5SYE7 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NHSL1Q5SYE7 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NHSL1Q5SYE7 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NHSL1Q5SYE7 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NHSL1Q5SYE7 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NHSL1Q5SYE7 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NHSL1Q5SYE7 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NHSL1Q5SYE7 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NHSL1Q5SYE7 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NHSL1Q5SYE7 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NHSL1Q5SYE7 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NHSL1Q5SYE7 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NHSL1Q5SYE7 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NHSL1Q5SYE7 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NHSL1Q5SYE7 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NHSL1Q5SYE7 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NHSL1Q5SYE7 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NHSL1Q5SYE7 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NHSL1Q5SYE7 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NHSL1Q5SYE7 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NHSL1Q5SYE7 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NHSL1Q5SYE7 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NHSL1Q5SYE7 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NHSL1Q5SYE7 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NHSL1Q5SYE7 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NHSL1Q5SYE7 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NHSL1Q5SYE7 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NHSL1Q5SYE7 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NHSL1Q5SYE7 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NHSL1Q5SYE7 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NHSL1Q5SYE7 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NHSL1Q5SYE7 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NHSL1Q5SYE7 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
NHSL1Q5SYE7 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NHSL1Q5SYE7 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NHSL1Q5SYE7 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NHSL1Q5SYE7 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NHSL1Q5SYE7 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NHSL1Q5SYE7 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NHSL1Q5SYE7 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NHSL1Q5SYE7 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NHSL1Q5SYE7 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NHSL1Q5SYE7 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC24.95■■□□□ 1.59
NHSL1Q5SYE7 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
NHSL1Q5SYE7 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NHSL1Q5SYE7 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NHSL1Q5SYE7 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NHSL1Q5SYE7 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NHSL1Q5SYE7 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NHSL1Q5SYE7 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NHSL1Q5SYE7 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
NHSL1Q5SYE7 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NHSL1Q5SYE7 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NHSL1Q5SYE7 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NHSL1Q5SYE7 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NHSL1Q5SYE7 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NHSL1Q5SYE7 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NHSL1Q5SYE7 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NHSL1Q5SYE7 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NHSL1Q5SYE7 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NHSL1Q5SYE7 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NHSL1Q5SYE7 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NHSL1Q5SYE7 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms