Protein–RNA interactions for Protein: Q4LDE5

SVEP1, Sushi, von Willebrand factor type A, EGF and pentraxin domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 3,571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SVEP1Q4LDE5 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SVEP1Q4LDE5 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SVEP1Q4LDE5 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SVEP1Q4LDE5 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SVEP1Q4LDE5 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SVEP1Q4LDE5 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SVEP1Q4LDE5 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SVEP1Q4LDE5 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SVEP1Q4LDE5 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SVEP1Q4LDE5 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SVEP1Q4LDE5 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SVEP1Q4LDE5 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SVEP1Q4LDE5 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SVEP1Q4LDE5 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SVEP1Q4LDE5 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SVEP1Q4LDE5 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SVEP1Q4LDE5 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SVEP1Q4LDE5 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SVEP1Q4LDE5 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SVEP1Q4LDE5 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SVEP1Q4LDE5 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SVEP1Q4LDE5 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SVEP1Q4LDE5 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SVEP1Q4LDE5 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SVEP1Q4LDE5 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SVEP1Q4LDE5 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SVEP1Q4LDE5 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SVEP1Q4LDE5 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SVEP1Q4LDE5 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SVEP1Q4LDE5 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SVEP1Q4LDE5 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SVEP1Q4LDE5 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SVEP1Q4LDE5 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SVEP1Q4LDE5 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SVEP1Q4LDE5 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SVEP1Q4LDE5 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SVEP1Q4LDE5 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SVEP1Q4LDE5 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SVEP1Q4LDE5 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SVEP1Q4LDE5 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SVEP1Q4LDE5 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SVEP1Q4LDE5 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SVEP1Q4LDE5 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SVEP1Q4LDE5 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SVEP1Q4LDE5 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SVEP1Q4LDE5 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SVEP1Q4LDE5 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SVEP1Q4LDE5 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SVEP1Q4LDE5 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SVEP1Q4LDE5 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SVEP1Q4LDE5 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SVEP1Q4LDE5 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SVEP1Q4LDE5 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SVEP1Q4LDE5 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SVEP1Q4LDE5 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SVEP1Q4LDE5 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SVEP1Q4LDE5 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SVEP1Q4LDE5 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SVEP1Q4LDE5 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SVEP1Q4LDE5 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SVEP1Q4LDE5 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SVEP1Q4LDE5 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SVEP1Q4LDE5 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SVEP1Q4LDE5 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SVEP1Q4LDE5 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SVEP1Q4LDE5 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SVEP1Q4LDE5 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SVEP1Q4LDE5 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SVEP1Q4LDE5 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SVEP1Q4LDE5 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SVEP1Q4LDE5 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SVEP1Q4LDE5 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SVEP1Q4LDE5 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SVEP1Q4LDE5 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SVEP1Q4LDE5 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SVEP1Q4LDE5 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SVEP1Q4LDE5 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SVEP1Q4LDE5 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SVEP1Q4LDE5 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SVEP1Q4LDE5 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SVEP1Q4LDE5 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SVEP1Q4LDE5 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SVEP1Q4LDE5 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SVEP1Q4LDE5 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SVEP1Q4LDE5 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SVEP1Q4LDE5 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SVEP1Q4LDE5 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SVEP1Q4LDE5 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SVEP1Q4LDE5 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SVEP1Q4LDE5 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SVEP1Q4LDE5 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SVEP1Q4LDE5 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SVEP1Q4LDE5 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SVEP1Q4LDE5 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SVEP1Q4LDE5 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SVEP1Q4LDE5 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SVEP1Q4LDE5 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SVEP1Q4LDE5 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SVEP1Q4LDE5 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SVEP1Q4LDE5 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms