Protein–RNA interactions for Protein: Q4G0W2

DUSP28, Dual specificity phosphatase 28, humanhuman

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP28Q4G0W2 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
DUSP28Q4G0W2 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
DUSP28Q4G0W2 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
DUSP28Q4G0W2 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
DUSP28Q4G0W2 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
DUSP28Q4G0W2 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
DUSP28Q4G0W2 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
DUSP28Q4G0W2 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
DUSP28Q4G0W2 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
DUSP28Q4G0W2 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
DUSP28Q4G0W2 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
DUSP28Q4G0W2 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
DUSP28Q4G0W2 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
DUSP28Q4G0W2 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
DUSP28Q4G0W2 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
DUSP28Q4G0W2 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
DUSP28Q4G0W2 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
DUSP28Q4G0W2 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
DUSP28Q4G0W2 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
DUSP28Q4G0W2 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
DUSP28Q4G0W2 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
DUSP28Q4G0W2 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
DUSP28Q4G0W2 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
DUSP28Q4G0W2 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
DUSP28Q4G0W2 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
DUSP28Q4G0W2 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
DUSP28Q4G0W2 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
DUSP28Q4G0W2 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
DUSP28Q4G0W2 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
DUSP28Q4G0W2 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
DUSP28Q4G0W2 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
DUSP28Q4G0W2 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
DUSP28Q4G0W2 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
DUSP28Q4G0W2 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
DUSP28Q4G0W2 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
DUSP28Q4G0W2 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
DUSP28Q4G0W2 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
DUSP28Q4G0W2 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
DUSP28Q4G0W2 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
DUSP28Q4G0W2 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
DUSP28Q4G0W2 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
DUSP28Q4G0W2 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
DUSP28Q4G0W2 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
DUSP28Q4G0W2 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
DUSP28Q4G0W2 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
DUSP28Q4G0W2 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
DUSP28Q4G0W2 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
DUSP28Q4G0W2 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
DUSP28Q4G0W2 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
DUSP28Q4G0W2 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
DUSP28Q4G0W2 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
DUSP28Q4G0W2 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
DUSP28Q4G0W2 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
DUSP28Q4G0W2 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
DUSP28Q4G0W2 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
DUSP28Q4G0W2 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
DUSP28Q4G0W2 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
DUSP28Q4G0W2 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
DUSP28Q4G0W2 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
DUSP28Q4G0W2 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
DUSP28Q4G0W2 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
DUSP28Q4G0W2 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
DUSP28Q4G0W2 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
DUSP28Q4G0W2 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
DUSP28Q4G0W2 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
DUSP28Q4G0W2 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
DUSP28Q4G0W2 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC20.58■□□□□ 0.89
DUSP28Q4G0W2 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
DUSP28Q4G0W2 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
DUSP28Q4G0W2 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
DUSP28Q4G0W2 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
DUSP28Q4G0W2 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
DUSP28Q4G0W2 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
DUSP28Q4G0W2 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
DUSP28Q4G0W2 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
DUSP28Q4G0W2 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
DUSP28Q4G0W2 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
DUSP28Q4G0W2 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
DUSP28Q4G0W2 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
DUSP28Q4G0W2 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
DUSP28Q4G0W2 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
DUSP28Q4G0W2 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
DUSP28Q4G0W2 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
DUSP28Q4G0W2 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
DUSP28Q4G0W2 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
DUSP28Q4G0W2 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
DUSP28Q4G0W2 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
DUSP28Q4G0W2 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
DUSP28Q4G0W2 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
DUSP28Q4G0W2 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
DUSP28Q4G0W2 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
DUSP28Q4G0W2 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC20.57■□□□□ 0.88
DUSP28Q4G0W2 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
DUSP28Q4G0W2 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
DUSP28Q4G0W2 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
DUSP28Q4G0W2 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
DUSP28Q4G0W2 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
DUSP28Q4G0W2 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
DUSP28Q4G0W2 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
DUSP28Q4G0W2 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms