Protein–RNA interactions for Protein: Q49AN0

CRY2, Cryptochrome-2, humanhuman

Predictions only

Length 593 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRY2Q49AN0 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CRY2Q49AN0 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CRY2Q49AN0 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CRY2Q49AN0 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CRY2Q49AN0 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CRY2Q49AN0 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CRY2Q49AN0 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CRY2Q49AN0 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CRY2Q49AN0 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CRY2Q49AN0 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CRY2Q49AN0 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CRY2Q49AN0 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CRY2Q49AN0 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CRY2Q49AN0 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CRY2Q49AN0 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CRY2Q49AN0 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CRY2Q49AN0 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CRY2Q49AN0 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CRY2Q49AN0 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CRY2Q49AN0 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CRY2Q49AN0 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CRY2Q49AN0 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CRY2Q49AN0 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CRY2Q49AN0 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CRY2Q49AN0 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CRY2Q49AN0 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CRY2Q49AN0 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CRY2Q49AN0 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CRY2Q49AN0 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CRY2Q49AN0 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CRY2Q49AN0 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CRY2Q49AN0 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CRY2Q49AN0 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CRY2Q49AN0 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CRY2Q49AN0 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CRY2Q49AN0 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CRY2Q49AN0 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CRY2Q49AN0 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CRY2Q49AN0 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CRY2Q49AN0 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CRY2Q49AN0 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CRY2Q49AN0 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CRY2Q49AN0 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CRY2Q49AN0 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CRY2Q49AN0 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CRY2Q49AN0 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CRY2Q49AN0 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CRY2Q49AN0 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CRY2Q49AN0 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CRY2Q49AN0 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CRY2Q49AN0 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CRY2Q49AN0 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CRY2Q49AN0 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CRY2Q49AN0 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CRY2Q49AN0 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CRY2Q49AN0 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CRY2Q49AN0 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CRY2Q49AN0 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CRY2Q49AN0 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CRY2Q49AN0 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CRY2Q49AN0 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CRY2Q49AN0 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CRY2Q49AN0 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CRY2Q49AN0 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CRY2Q49AN0 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CRY2Q49AN0 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CRY2Q49AN0 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CRY2Q49AN0 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CRY2Q49AN0 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CRY2Q49AN0 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CRY2Q49AN0 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CRY2Q49AN0 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CRY2Q49AN0 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CRY2Q49AN0 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CRY2Q49AN0 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CRY2Q49AN0 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CRY2Q49AN0 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CRY2Q49AN0 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CRY2Q49AN0 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CRY2Q49AN0 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CRY2Q49AN0 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CRY2Q49AN0 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CRY2Q49AN0 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CRY2Q49AN0 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CRY2Q49AN0 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CRY2Q49AN0 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CRY2Q49AN0 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CRY2Q49AN0 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CRY2Q49AN0 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CRY2Q49AN0 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CRY2Q49AN0 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CRY2Q49AN0 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CRY2Q49AN0 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CRY2Q49AN0 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CRY2Q49AN0 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CRY2Q49AN0 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CRY2Q49AN0 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CRY2Q49AN0 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CRY2Q49AN0 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CRY2Q49AN0 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms