Protein–RNA interactions for Protein: Q49AG3

ZBED5, Zinc finger BED domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 693 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED5Q49AG3 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZBED5Q49AG3 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZBED5Q49AG3 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZBED5Q49AG3 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZBED5Q49AG3 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
ZBED5Q49AG3 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZBED5Q49AG3 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZBED5Q49AG3 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZBED5Q49AG3 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZBED5Q49AG3 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZBED5Q49AG3 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZBED5Q49AG3 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZBED5Q49AG3 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZBED5Q49AG3 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZBED5Q49AG3 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZBED5Q49AG3 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZBED5Q49AG3 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZBED5Q49AG3 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZBED5Q49AG3 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZBED5Q49AG3 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
ZBED5Q49AG3 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZBED5Q49AG3 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZBED5Q49AG3 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZBED5Q49AG3 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZBED5Q49AG3 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZBED5Q49AG3 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZBED5Q49AG3 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZBED5Q49AG3 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZBED5Q49AG3 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZBED5Q49AG3 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZBED5Q49AG3 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZBED5Q49AG3 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZBED5Q49AG3 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZBED5Q49AG3 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZBED5Q49AG3 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ZBED5Q49AG3 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ZBED5Q49AG3 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ZBED5Q49AG3 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ZBED5Q49AG3 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ZBED5Q49AG3 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ZBED5Q49AG3 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
ZBED5Q49AG3 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
ZBED5Q49AG3 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
ZBED5Q49AG3 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ZBED5Q49AG3 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ZBED5Q49AG3 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
ZBED5Q49AG3 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ZBED5Q49AG3 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ZBED5Q49AG3 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ZBED5Q49AG3 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ZBED5Q49AG3 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ZBED5Q49AG3 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
ZBED5Q49AG3 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ZBED5Q49AG3 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ZBED5Q49AG3 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ZBED5Q49AG3 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ZBED5Q49AG3 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ZBED5Q49AG3 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ZBED5Q49AG3 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ZBED5Q49AG3 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ZBED5Q49AG3 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ZBED5Q49AG3 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ZBED5Q49AG3 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ZBED5Q49AG3 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ZBED5Q49AG3 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ZBED5Q49AG3 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ZBED5Q49AG3 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ZBED5Q49AG3 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ZBED5Q49AG3 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZBED5Q49AG3 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZBED5Q49AG3 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZBED5Q49AG3 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZBED5Q49AG3 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZBED5Q49AG3 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZBED5Q49AG3 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZBED5Q49AG3 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZBED5Q49AG3 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZBED5Q49AG3 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZBED5Q49AG3 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZBED5Q49AG3 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZBED5Q49AG3 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZBED5Q49AG3 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZBED5Q49AG3 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZBED5Q49AG3 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZBED5Q49AG3 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZBED5Q49AG3 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZBED5Q49AG3 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZBED5Q49AG3 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZBED5Q49AG3 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZBED5Q49AG3 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
ZBED5Q49AG3 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZBED5Q49AG3 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
ZBED5Q49AG3 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
ZBED5Q49AG3 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
ZBED5Q49AG3 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZBED5Q49AG3 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZBED5Q49AG3 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZBED5Q49AG3 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZBED5Q49AG3 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZBED5Q49AG3 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms