Protein–RNA interactions for Protein: Q494V2

CFAP100, Cilia- and flagella-associated protein 100, humanhuman

Predictions only

Length 611 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP100Q494V2 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CFAP100Q494V2 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CFAP100Q494V2 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CFAP100Q494V2 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CFAP100Q494V2 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CFAP100Q494V2 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CFAP100Q494V2 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CFAP100Q494V2 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CFAP100Q494V2 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CFAP100Q494V2 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CFAP100Q494V2 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CFAP100Q494V2 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CFAP100Q494V2 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CFAP100Q494V2 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CFAP100Q494V2 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CFAP100Q494V2 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CFAP100Q494V2 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CFAP100Q494V2 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CFAP100Q494V2 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CFAP100Q494V2 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CFAP100Q494V2 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CFAP100Q494V2 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CFAP100Q494V2 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CFAP100Q494V2 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CFAP100Q494V2 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CFAP100Q494V2 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CFAP100Q494V2 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CFAP100Q494V2 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CFAP100Q494V2 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CFAP100Q494V2 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CFAP100Q494V2 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CFAP100Q494V2 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CFAP100Q494V2 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CFAP100Q494V2 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CFAP100Q494V2 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CFAP100Q494V2 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CFAP100Q494V2 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CFAP100Q494V2 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CFAP100Q494V2 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CFAP100Q494V2 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CFAP100Q494V2 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CFAP100Q494V2 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CFAP100Q494V2 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CFAP100Q494V2 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CFAP100Q494V2 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CFAP100Q494V2 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CFAP100Q494V2 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CFAP100Q494V2 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CFAP100Q494V2 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CFAP100Q494V2 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CFAP100Q494V2 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CFAP100Q494V2 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CFAP100Q494V2 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CFAP100Q494V2 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CFAP100Q494V2 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CFAP100Q494V2 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CFAP100Q494V2 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CFAP100Q494V2 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CFAP100Q494V2 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CFAP100Q494V2 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CFAP100Q494V2 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CFAP100Q494V2 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CFAP100Q494V2 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CFAP100Q494V2 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CFAP100Q494V2 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CFAP100Q494V2 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CFAP100Q494V2 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CFAP100Q494V2 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CFAP100Q494V2 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CFAP100Q494V2 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CFAP100Q494V2 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CFAP100Q494V2 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CFAP100Q494V2 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CFAP100Q494V2 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CFAP100Q494V2 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CFAP100Q494V2 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CFAP100Q494V2 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CFAP100Q494V2 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CFAP100Q494V2 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CFAP100Q494V2 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CFAP100Q494V2 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CFAP100Q494V2 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CFAP100Q494V2 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CFAP100Q494V2 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CFAP100Q494V2 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CFAP100Q494V2 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CFAP100Q494V2 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CFAP100Q494V2 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CFAP100Q494V2 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CFAP100Q494V2 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CFAP100Q494V2 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CFAP100Q494V2 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CFAP100Q494V2 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CFAP100Q494V2 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CFAP100Q494V2 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CFAP100Q494V2 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CFAP100Q494V2 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CFAP100Q494V2 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CFAP100Q494V2 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CFAP100Q494V2 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms