Protein–RNA interactions for Protein: Q3B7T1

EDRF1, Erythroid differentiation-related factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDRF1Q3B7T1 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
EDRF1Q3B7T1 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
EDRF1Q3B7T1 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
EDRF1Q3B7T1 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
EDRF1Q3B7T1 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
EDRF1Q3B7T1 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
EDRF1Q3B7T1 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
EDRF1Q3B7T1 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
EDRF1Q3B7T1 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
EDRF1Q3B7T1 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
EDRF1Q3B7T1 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
EDRF1Q3B7T1 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
EDRF1Q3B7T1 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
EDRF1Q3B7T1 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
EDRF1Q3B7T1 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
EDRF1Q3B7T1 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
EDRF1Q3B7T1 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
EDRF1Q3B7T1 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC20.24■□□□□ 0.83
EDRF1Q3B7T1 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
EDRF1Q3B7T1 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
EDRF1Q3B7T1 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
EDRF1Q3B7T1 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
EDRF1Q3B7T1 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
EDRF1Q3B7T1 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
EDRF1Q3B7T1 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
EDRF1Q3B7T1 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
EDRF1Q3B7T1 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
EDRF1Q3B7T1 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
EDRF1Q3B7T1 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
EDRF1Q3B7T1 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
EDRF1Q3B7T1 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
EDRF1Q3B7T1 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
EDRF1Q3B7T1 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
EDRF1Q3B7T1 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
EDRF1Q3B7T1 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
EDRF1Q3B7T1 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
EDRF1Q3B7T1 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
EDRF1Q3B7T1 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
EDRF1Q3B7T1 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
EDRF1Q3B7T1 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
EDRF1Q3B7T1 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
EDRF1Q3B7T1 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
EDRF1Q3B7T1 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
EDRF1Q3B7T1 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
EDRF1Q3B7T1 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
EDRF1Q3B7T1 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
EDRF1Q3B7T1 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
EDRF1Q3B7T1 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
EDRF1Q3B7T1 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
EDRF1Q3B7T1 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
EDRF1Q3B7T1 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
EDRF1Q3B7T1 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
EDRF1Q3B7T1 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
EDRF1Q3B7T1 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
EDRF1Q3B7T1 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
EDRF1Q3B7T1 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
EDRF1Q3B7T1 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
EDRF1Q3B7T1 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
EDRF1Q3B7T1 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
EDRF1Q3B7T1 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
EDRF1Q3B7T1 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
EDRF1Q3B7T1 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
EDRF1Q3B7T1 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
EDRF1Q3B7T1 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
EDRF1Q3B7T1 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
EDRF1Q3B7T1 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
EDRF1Q3B7T1 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
EDRF1Q3B7T1 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
EDRF1Q3B7T1 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
EDRF1Q3B7T1 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
EDRF1Q3B7T1 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
EDRF1Q3B7T1 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
EDRF1Q3B7T1 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
EDRF1Q3B7T1 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
EDRF1Q3B7T1 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
EDRF1Q3B7T1 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
EDRF1Q3B7T1 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
EDRF1Q3B7T1 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
EDRF1Q3B7T1 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
EDRF1Q3B7T1 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC20.22■□□□□ 0.83
EDRF1Q3B7T1 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
EDRF1Q3B7T1 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
EDRF1Q3B7T1 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
EDRF1Q3B7T1 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
EDRF1Q3B7T1 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
EDRF1Q3B7T1 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
EDRF1Q3B7T1 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
EDRF1Q3B7T1 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
EDRF1Q3B7T1 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
EDRF1Q3B7T1 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
EDRF1Q3B7T1 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
EDRF1Q3B7T1 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
EDRF1Q3B7T1 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
EDRF1Q3B7T1 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
EDRF1Q3B7T1 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
EDRF1Q3B7T1 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
EDRF1Q3B7T1 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
EDRF1Q3B7T1 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
EDRF1Q3B7T1 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
EDRF1Q3B7T1 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms