Protein–RNA interactions for Protein: Q2M3C7

SPHKAP, A-kinase anchor protein SPHKAP, humanhuman

Predictions only

Length 1,700 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPHKAPQ2M3C7 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
SPHKAPQ2M3C7 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SPHKAPQ2M3C7 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SPHKAPQ2M3C7 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SPHKAPQ2M3C7 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SPHKAPQ2M3C7 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SPHKAPQ2M3C7 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SPHKAPQ2M3C7 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SPHKAPQ2M3C7 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SPHKAPQ2M3C7 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SPHKAPQ2M3C7 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SPHKAPQ2M3C7 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SPHKAPQ2M3C7 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SPHKAPQ2M3C7 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SPHKAPQ2M3C7 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SPHKAPQ2M3C7 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SPHKAPQ2M3C7 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SPHKAPQ2M3C7 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SPHKAPQ2M3C7 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SPHKAPQ2M3C7 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
SPHKAPQ2M3C7 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SPHKAPQ2M3C7 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SPHKAPQ2M3C7 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SPHKAPQ2M3C7 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SPHKAPQ2M3C7 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SPHKAPQ2M3C7 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SPHKAPQ2M3C7 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SPHKAPQ2M3C7 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SPHKAPQ2M3C7 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SPHKAPQ2M3C7 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
SPHKAPQ2M3C7 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
SPHKAPQ2M3C7 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SPHKAPQ2M3C7 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SPHKAPQ2M3C7 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SPHKAPQ2M3C7 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SPHKAPQ2M3C7 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SPHKAPQ2M3C7 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SPHKAPQ2M3C7 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SPHKAPQ2M3C7 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SPHKAPQ2M3C7 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SPHKAPQ2M3C7 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SPHKAPQ2M3C7 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SPHKAPQ2M3C7 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SPHKAPQ2M3C7 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SPHKAPQ2M3C7 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SPHKAPQ2M3C7 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SPHKAPQ2M3C7 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SPHKAPQ2M3C7 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SPHKAPQ2M3C7 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
SPHKAPQ2M3C7 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SPHKAPQ2M3C7 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SPHKAPQ2M3C7 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SPHKAPQ2M3C7 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SPHKAPQ2M3C7 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SPHKAPQ2M3C7 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SPHKAPQ2M3C7 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SPHKAPQ2M3C7 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
SPHKAPQ2M3C7 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SPHKAPQ2M3C7 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SPHKAPQ2M3C7 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SPHKAPQ2M3C7 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SPHKAPQ2M3C7 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SPHKAPQ2M3C7 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SPHKAPQ2M3C7 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SPHKAPQ2M3C7 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SPHKAPQ2M3C7 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SPHKAPQ2M3C7 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SPHKAPQ2M3C7 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SPHKAPQ2M3C7 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SPHKAPQ2M3C7 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SPHKAPQ2M3C7 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SPHKAPQ2M3C7 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SPHKAPQ2M3C7 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
SPHKAPQ2M3C7 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SPHKAPQ2M3C7 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SPHKAPQ2M3C7 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SPHKAPQ2M3C7 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SPHKAPQ2M3C7 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SPHKAPQ2M3C7 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SPHKAPQ2M3C7 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SPHKAPQ2M3C7 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SPHKAPQ2M3C7 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SPHKAPQ2M3C7 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SPHKAPQ2M3C7 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SPHKAPQ2M3C7 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SPHKAPQ2M3C7 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SPHKAPQ2M3C7 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SPHKAPQ2M3C7 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SPHKAPQ2M3C7 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SPHKAPQ2M3C7 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SPHKAPQ2M3C7 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SPHKAPQ2M3C7 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SPHKAPQ2M3C7 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SPHKAPQ2M3C7 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SPHKAPQ2M3C7 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SPHKAPQ2M3C7 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SPHKAPQ2M3C7 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SPHKAPQ2M3C7 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
SPHKAPQ2M3C7 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SPHKAPQ2M3C7 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
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