Protein–RNA interactions for Protein: Q17RW2

COL24A1, Collagen alpha-1(XXIV) chain, humanhuman

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Length 1,714 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL24A1Q17RW2 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
COL24A1Q17RW2 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
COL24A1Q17RW2 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
COL24A1Q17RW2 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
COL24A1Q17RW2 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
COL24A1Q17RW2 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
COL24A1Q17RW2 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
COL24A1Q17RW2 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
COL24A1Q17RW2 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
COL24A1Q17RW2 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
COL24A1Q17RW2 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
COL24A1Q17RW2 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
COL24A1Q17RW2 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
COL24A1Q17RW2 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
COL24A1Q17RW2 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.31
COL24A1Q17RW2 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
COL24A1Q17RW2 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
COL24A1Q17RW2 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
COL24A1Q17RW2 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
COL24A1Q17RW2 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
COL24A1Q17RW2 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
COL24A1Q17RW2 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
COL24A1Q17RW2 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
COL24A1Q17RW2 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
COL24A1Q17RW2 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
COL24A1Q17RW2 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
COL24A1Q17RW2 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
COL24A1Q17RW2 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
COL24A1Q17RW2 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
COL24A1Q17RW2 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
COL24A1Q17RW2 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
COL24A1Q17RW2 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
COL24A1Q17RW2 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
COL24A1Q17RW2 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
COL24A1Q17RW2 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
COL24A1Q17RW2 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
COL24A1Q17RW2 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
COL24A1Q17RW2 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
COL24A1Q17RW2 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
COL24A1Q17RW2 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
COL24A1Q17RW2 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
COL24A1Q17RW2 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
COL24A1Q17RW2 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
COL24A1Q17RW2 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
COL24A1Q17RW2 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
COL24A1Q17RW2 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
COL24A1Q17RW2 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
COL24A1Q17RW2 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
COL24A1Q17RW2 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
COL24A1Q17RW2 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
COL24A1Q17RW2 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
COL24A1Q17RW2 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
COL24A1Q17RW2 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
COL24A1Q17RW2 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
COL24A1Q17RW2 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
COL24A1Q17RW2 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
COL24A1Q17RW2 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
COL24A1Q17RW2 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
COL24A1Q17RW2 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
COL24A1Q17RW2 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
COL24A1Q17RW2 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
COL24A1Q17RW2 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
COL24A1Q17RW2 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
COL24A1Q17RW2 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
COL24A1Q17RW2 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
COL24A1Q17RW2 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
COL24A1Q17RW2 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
COL24A1Q17RW2 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
COL24A1Q17RW2 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
COL24A1Q17RW2 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
COL24A1Q17RW2 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
COL24A1Q17RW2 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
COL24A1Q17RW2 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
COL24A1Q17RW2 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
COL24A1Q17RW2 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
COL24A1Q17RW2 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
COL24A1Q17RW2 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
COL24A1Q17RW2 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
COL24A1Q17RW2 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
COL24A1Q17RW2 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
COL24A1Q17RW2 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
COL24A1Q17RW2 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
COL24A1Q17RW2 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
COL24A1Q17RW2 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
COL24A1Q17RW2 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
COL24A1Q17RW2 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
COL24A1Q17RW2 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
COL24A1Q17RW2 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
COL24A1Q17RW2 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
COL24A1Q17RW2 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
COL24A1Q17RW2 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
COL24A1Q17RW2 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
COL24A1Q17RW2 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
COL24A1Q17RW2 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
COL24A1Q17RW2 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
COL24A1Q17RW2 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
COL24A1Q17RW2 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
COL24A1Q17RW2 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
COL24A1Q17RW2 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
COL24A1Q17RW2 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
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