Protein–RNA interactions for Protein: Q16798

ME3, NADP-dependent malic enzyme, mitochondrial, humanhuman

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Length 604 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ME3Q16798 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ME3Q16798 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ME3Q16798 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ME3Q16798 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ME3Q16798 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ME3Q16798 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ME3Q16798 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ME3Q16798 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ME3Q16798 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ME3Q16798 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ME3Q16798 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ME3Q16798 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ME3Q16798 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ME3Q16798 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ME3Q16798 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ME3Q16798 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ME3Q16798 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ME3Q16798 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ME3Q16798 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ME3Q16798 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ME3Q16798 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ME3Q16798 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
ME3Q16798 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
ME3Q16798 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ME3Q16798 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ME3Q16798 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ME3Q16798 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
ME3Q16798 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
ME3Q16798 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
ME3Q16798 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
ME3Q16798 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ME3Q16798 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ME3Q16798 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ME3Q16798 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
ME3Q16798 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
ME3Q16798 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ME3Q16798 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ME3Q16798 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ME3Q16798 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ME3Q16798 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ME3Q16798 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ME3Q16798 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ME3Q16798 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ME3Q16798 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ME3Q16798 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ME3Q16798 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ME3Q16798 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ME3Q16798 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ME3Q16798 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ME3Q16798 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ME3Q16798 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ME3Q16798 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ME3Q16798 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
ME3Q16798 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ME3Q16798 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ME3Q16798 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ME3Q16798 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
ME3Q16798 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ME3Q16798 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ME3Q16798 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ME3Q16798 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ME3Q16798 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
ME3Q16798 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ME3Q16798 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ME3Q16798 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ME3Q16798 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ME3Q16798 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
ME3Q16798 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
ME3Q16798 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ME3Q16798 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ME3Q16798 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ME3Q16798 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
ME3Q16798 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ME3Q16798 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ME3Q16798 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ME3Q16798 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ME3Q16798 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ME3Q16798 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ME3Q16798 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ME3Q16798 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ME3Q16798 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ME3Q16798 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ME3Q16798 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ME3Q16798 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ME3Q16798 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ME3Q16798 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
ME3Q16798 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.07
ME3Q16798 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ME3Q16798 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ME3Q16798 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ME3Q16798 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ME3Q16798 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ME3Q16798 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ME3Q16798 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ME3Q16798 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ME3Q16798 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ME3Q16798 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ME3Q16798 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ME3Q16798 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ME3Q16798 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
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