Protein–RNA interactions for Protein: Q16595

FXN, Frataxin, mitochondrial, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FXNQ16595 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
FXNQ16595 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
FXNQ16595 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
FXNQ16595 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
FXNQ16595 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
FXNQ16595 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
FXNQ16595 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
FXNQ16595 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
FXNQ16595 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
FXNQ16595 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
FXNQ16595 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
FXNQ16595 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FXNQ16595 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
FXNQ16595 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FXNQ16595 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FXNQ16595 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FXNQ16595 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FXNQ16595 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FXNQ16595 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FXNQ16595 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FXNQ16595 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FXNQ16595 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FXNQ16595 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
FXNQ16595 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FXNQ16595 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
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FXNQ16595 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
FXNQ16595 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
FXNQ16595 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
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FXNQ16595 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
FXNQ16595 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FXNQ16595 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FXNQ16595 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
FXNQ16595 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FXNQ16595 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
FXNQ16595 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FXNQ16595 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
FXNQ16595 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
FXNQ16595 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FXNQ16595 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FXNQ16595 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FXNQ16595 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FXNQ16595 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FXNQ16595 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FXNQ16595 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
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FXNQ16595 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FXNQ16595 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FXNQ16595 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
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FXNQ16595 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FXNQ16595 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
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FXNQ16595 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FXNQ16595 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
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FXNQ16595 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
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FXNQ16595 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FXNQ16595 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
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FXNQ16595 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FXNQ16595 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
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FXNQ16595 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FXNQ16595 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FXNQ16595 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FXNQ16595 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FXNQ16595 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FXNQ16595 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FXNQ16595 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FXNQ16595 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FXNQ16595 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FXNQ16595 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FXNQ16595 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FXNQ16595 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FXNQ16595 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FXNQ16595 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FXNQ16595 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FXNQ16595 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FXNQ16595 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FXNQ16595 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FXNQ16595 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
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