Protein–RNA interactions for Protein: Q16478

GRIK5, Glutamate receptor ionotropic, kainate 5, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK5Q16478 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GRIK5Q16478 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GRIK5Q16478 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GRIK5Q16478 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GRIK5Q16478 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GRIK5Q16478 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GRIK5Q16478 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
GRIK5Q16478 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
GRIK5Q16478 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GRIK5Q16478 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GRIK5Q16478 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GRIK5Q16478 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GRIK5Q16478 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GRIK5Q16478 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GRIK5Q16478 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
GRIK5Q16478 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
GRIK5Q16478 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
GRIK5Q16478 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
GRIK5Q16478 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
GRIK5Q16478 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
GRIK5Q16478 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GRIK5Q16478 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GRIK5Q16478 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GRIK5Q16478 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GRIK5Q16478 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GRIK5Q16478 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GRIK5Q16478 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GRIK5Q16478 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GRIK5Q16478 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GRIK5Q16478 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GRIK5Q16478 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GRIK5Q16478 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GRIK5Q16478 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GRIK5Q16478 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GRIK5Q16478 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GRIK5Q16478 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GRIK5Q16478 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GRIK5Q16478 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GRIK5Q16478 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GRIK5Q16478 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GRIK5Q16478 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GRIK5Q16478 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GRIK5Q16478 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GRIK5Q16478 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GRIK5Q16478 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GRIK5Q16478 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GRIK5Q16478 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GRIK5Q16478 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GRIK5Q16478 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GRIK5Q16478 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GRIK5Q16478 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GRIK5Q16478 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GRIK5Q16478 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GRIK5Q16478 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
GRIK5Q16478 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GRIK5Q16478 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GRIK5Q16478 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GRIK5Q16478 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GRIK5Q16478 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GRIK5Q16478 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GRIK5Q16478 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GRIK5Q16478 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GRIK5Q16478 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GRIK5Q16478 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GRIK5Q16478 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GRIK5Q16478 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GRIK5Q16478 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GRIK5Q16478 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GRIK5Q16478 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GRIK5Q16478 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GRIK5Q16478 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GRIK5Q16478 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GRIK5Q16478 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GRIK5Q16478 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GRIK5Q16478 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
GRIK5Q16478 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GRIK5Q16478 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GRIK5Q16478 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GRIK5Q16478 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
GRIK5Q16478 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GRIK5Q16478 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GRIK5Q16478 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GRIK5Q16478 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GRIK5Q16478 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GRIK5Q16478 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GRIK5Q16478 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GRIK5Q16478 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GRIK5Q16478 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GRIK5Q16478 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GRIK5Q16478 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
GRIK5Q16478 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GRIK5Q16478 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GRIK5Q16478 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GRIK5Q16478 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GRIK5Q16478 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GRIK5Q16478 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GRIK5Q16478 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GRIK5Q16478 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GRIK5Q16478 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
GRIK5Q16478 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
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