Protein–RNA interactions for Protein: Q15836

VAMP3, Vesicle-associated membrane protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP3Q15836 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
VAMP3Q15836 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
VAMP3Q15836 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
VAMP3Q15836 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
VAMP3Q15836 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
VAMP3Q15836 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
VAMP3Q15836 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
VAMP3Q15836 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
VAMP3Q15836 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
VAMP3Q15836 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
VAMP3Q15836 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
VAMP3Q15836 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
VAMP3Q15836 ELP1-201ENST00000374647 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
VAMP3Q15836 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
VAMP3Q15836 GRAMD4-202ENST00000406902 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
VAMP3Q15836 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
VAMP3Q15836 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
VAMP3Q15836 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
VAMP3Q15836 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
VAMP3Q15836 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
VAMP3Q15836 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
VAMP3Q15836 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
VAMP3Q15836 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
VAMP3Q15836 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
VAMP3Q15836 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
VAMP3Q15836 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
VAMP3Q15836 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
VAMP3Q15836 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
VAMP3Q15836 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
VAMP3Q15836 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
VAMP3Q15836 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
VAMP3Q15836 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
VAMP3Q15836 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
VAMP3Q15836 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
VAMP3Q15836 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
VAMP3Q15836 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
VAMP3Q15836 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
VAMP3Q15836 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
VAMP3Q15836 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
VAMP3Q15836 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
VAMP3Q15836 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
VAMP3Q15836 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
VAMP3Q15836 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
VAMP3Q15836 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
VAMP3Q15836 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
VAMP3Q15836 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
VAMP3Q15836 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
VAMP3Q15836 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
VAMP3Q15836 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC13.24□□□□□ -0.29
VAMP3Q15836 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
VAMP3Q15836 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
VAMP3Q15836 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
VAMP3Q15836 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
VAMP3Q15836 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
VAMP3Q15836 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
VAMP3Q15836 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
VAMP3Q15836 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
VAMP3Q15836 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
VAMP3Q15836 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
VAMP3Q15836 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
VAMP3Q15836 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
VAMP3Q15836 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
VAMP3Q15836 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
VAMP3Q15836 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
VAMP3Q15836 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
VAMP3Q15836 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
VAMP3Q15836 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
VAMP3Q15836 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
VAMP3Q15836 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
VAMP3Q15836 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
VAMP3Q15836 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
VAMP3Q15836 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
VAMP3Q15836 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
VAMP3Q15836 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
VAMP3Q15836 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
VAMP3Q15836 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
VAMP3Q15836 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
VAMP3Q15836 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
VAMP3Q15836 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
VAMP3Q15836 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
VAMP3Q15836 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
VAMP3Q15836 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
VAMP3Q15836 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
VAMP3Q15836 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
VAMP3Q15836 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC13.23□□□□□ -0.29
VAMP3Q15836 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
VAMP3Q15836 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
VAMP3Q15836 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
VAMP3Q15836 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
VAMP3Q15836 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
VAMP3Q15836 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
VAMP3Q15836 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
VAMP3Q15836 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
VAMP3Q15836 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
VAMP3Q15836 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
VAMP3Q15836 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
VAMP3Q15836 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
VAMP3Q15836 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
VAMP3Q15836 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
VAMP3Q15836 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
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