Protein–RNA interactions for Protein: Q15572

TAF1C, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 869 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1CQ15572 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TAF1CQ15572 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
TAF1CQ15572 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
TAF1CQ15572 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
TAF1CQ15572 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TAF1CQ15572 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TAF1CQ15572 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TAF1CQ15572 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TAF1CQ15572 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
TAF1CQ15572 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TAF1CQ15572 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TAF1CQ15572 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TAF1CQ15572 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
TAF1CQ15572 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
TAF1CQ15572 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TAF1CQ15572 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TAF1CQ15572 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TAF1CQ15572 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TAF1CQ15572 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TAF1CQ15572 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TAF1CQ15572 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TAF1CQ15572 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TAF1CQ15572 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TAF1CQ15572 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TAF1CQ15572 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TAF1CQ15572 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TAF1CQ15572 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TAF1CQ15572 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TAF1CQ15572 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TAF1CQ15572 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TAF1CQ15572 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
TAF1CQ15572 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TAF1CQ15572 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TAF1CQ15572 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
TAF1CQ15572 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TAF1CQ15572 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
TAF1CQ15572 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TAF1CQ15572 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TAF1CQ15572 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TAF1CQ15572 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
TAF1CQ15572 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TAF1CQ15572 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TAF1CQ15572 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TAF1CQ15572 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TAF1CQ15572 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
TAF1CQ15572 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TAF1CQ15572 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TAF1CQ15572 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TAF1CQ15572 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TAF1CQ15572 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
TAF1CQ15572 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TAF1CQ15572 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TAF1CQ15572 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
TAF1CQ15572 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TAF1CQ15572 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TAF1CQ15572 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TAF1CQ15572 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TAF1CQ15572 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TAF1CQ15572 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TAF1CQ15572 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
TAF1CQ15572 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
TAF1CQ15572 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
TAF1CQ15572 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TAF1CQ15572 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TAF1CQ15572 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TAF1CQ15572 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TAF1CQ15572 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TAF1CQ15572 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TAF1CQ15572 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TAF1CQ15572 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TAF1CQ15572 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TAF1CQ15572 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TAF1CQ15572 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
TAF1CQ15572 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TAF1CQ15572 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TAF1CQ15572 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TAF1CQ15572 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
TAF1CQ15572 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TAF1CQ15572 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TAF1CQ15572 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TAF1CQ15572 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TAF1CQ15572 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TAF1CQ15572 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TAF1CQ15572 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
TAF1CQ15572 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TAF1CQ15572 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TAF1CQ15572 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TAF1CQ15572 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TAF1CQ15572 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TAF1CQ15572 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
TAF1CQ15572 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
TAF1CQ15572 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TAF1CQ15572 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TAF1CQ15572 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TAF1CQ15572 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TAF1CQ15572 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TAF1CQ15572 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TAF1CQ15572 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TAF1CQ15572 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TAF1CQ15572 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms