Protein–RNA interactions for Protein: Q13939

CCIN, Calicin, humanhuman

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Length 588 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCINQ13939 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CCINQ13939 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CCINQ13939 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CCINQ13939 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CCINQ13939 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CCINQ13939 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CCINQ13939 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CCINQ13939 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
CCINQ13939 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
CCINQ13939 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CCINQ13939 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CCINQ13939 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CCINQ13939 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CCINQ13939 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CCINQ13939 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CCINQ13939 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CCINQ13939 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CCINQ13939 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CCINQ13939 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CCINQ13939 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CCINQ13939 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CCINQ13939 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CCINQ13939 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CCINQ13939 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CCINQ13939 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CCINQ13939 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CCINQ13939 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CCINQ13939 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CCINQ13939 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
CCINQ13939 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CCINQ13939 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
CCINQ13939 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CCINQ13939 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CCINQ13939 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CCINQ13939 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CCINQ13939 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CCINQ13939 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CCINQ13939 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CCINQ13939 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CCINQ13939 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CCINQ13939 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CCINQ13939 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CCINQ13939 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CCINQ13939 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CCINQ13939 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CCINQ13939 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CCINQ13939 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CCINQ13939 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CCINQ13939 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CCINQ13939 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
CCINQ13939 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CCINQ13939 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CCINQ13939 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CCINQ13939 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CCINQ13939 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CCINQ13939 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CCINQ13939 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC18.65■□□□□ 0.58
CCINQ13939 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CCINQ13939 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CCINQ13939 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CCINQ13939 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CCINQ13939 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CCINQ13939 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
CCINQ13939 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.58
CCINQ13939 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
CCINQ13939 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
CCINQ13939 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.58
CCINQ13939 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CCINQ13939 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CCINQ13939 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CCINQ13939 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CCINQ13939 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CCINQ13939 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CCINQ13939 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
CCINQ13939 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
CCINQ13939 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
CCINQ13939 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CCINQ13939 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CCINQ13939 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CCINQ13939 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CCINQ13939 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CCINQ13939 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
CCINQ13939 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CCINQ13939 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CCINQ13939 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CCINQ13939 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CCINQ13939 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CCINQ13939 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CCINQ13939 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CCINQ13939 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CCINQ13939 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CCINQ13939 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CCINQ13939 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CCINQ13939 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CCINQ13939 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CCINQ13939 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CCINQ13939 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
CCINQ13939 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
CCINQ13939 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CCINQ13939 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
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