Protein–RNA interactions for Protein: Q13889

GTF2H3, General transcription factor IIH subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H3Q13889 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GTF2H3Q13889 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GTF2H3Q13889 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GTF2H3Q13889 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GTF2H3Q13889 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GTF2H3Q13889 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GTF2H3Q13889 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GTF2H3Q13889 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GTF2H3Q13889 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GTF2H3Q13889 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GTF2H3Q13889 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GTF2H3Q13889 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GTF2H3Q13889 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GTF2H3Q13889 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GTF2H3Q13889 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GTF2H3Q13889 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GTF2H3Q13889 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GTF2H3Q13889 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
GTF2H3Q13889 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GTF2H3Q13889 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
GTF2H3Q13889 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GTF2H3Q13889 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GTF2H3Q13889 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GTF2H3Q13889 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GTF2H3Q13889 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GTF2H3Q13889 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GTF2H3Q13889 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GTF2H3Q13889 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GTF2H3Q13889 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GTF2H3Q13889 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GTF2H3Q13889 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GTF2H3Q13889 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GTF2H3Q13889 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GTF2H3Q13889 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GTF2H3Q13889 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GTF2H3Q13889 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GTF2H3Q13889 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GTF2H3Q13889 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GTF2H3Q13889 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GTF2H3Q13889 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GTF2H3Q13889 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GTF2H3Q13889 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
GTF2H3Q13889 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
GTF2H3Q13889 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GTF2H3Q13889 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GTF2H3Q13889 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
GTF2H3Q13889 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GTF2H3Q13889 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GTF2H3Q13889 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GTF2H3Q13889 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GTF2H3Q13889 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GTF2H3Q13889 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
GTF2H3Q13889 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GTF2H3Q13889 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GTF2H3Q13889 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GTF2H3Q13889 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GTF2H3Q13889 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GTF2H3Q13889 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GTF2H3Q13889 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GTF2H3Q13889 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GTF2H3Q13889 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GTF2H3Q13889 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GTF2H3Q13889 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GTF2H3Q13889 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GTF2H3Q13889 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
GTF2H3Q13889 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GTF2H3Q13889 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GTF2H3Q13889 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GTF2H3Q13889 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GTF2H3Q13889 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GTF2H3Q13889 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GTF2H3Q13889 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GTF2H3Q13889 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GTF2H3Q13889 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GTF2H3Q13889 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GTF2H3Q13889 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GTF2H3Q13889 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GTF2H3Q13889 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GTF2H3Q13889 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GTF2H3Q13889 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GTF2H3Q13889 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GTF2H3Q13889 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GTF2H3Q13889 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GTF2H3Q13889 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GTF2H3Q13889 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GTF2H3Q13889 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GTF2H3Q13889 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GTF2H3Q13889 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GTF2H3Q13889 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GTF2H3Q13889 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GTF2H3Q13889 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GTF2H3Q13889 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GTF2H3Q13889 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GTF2H3Q13889 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GTF2H3Q13889 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GTF2H3Q13889 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GTF2H3Q13889 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GTF2H3Q13889 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GTF2H3Q13889 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GTF2H3Q13889 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms