Protein–RNA interactions for Protein: Q13886

KLF9, Krueppel-like factor 9, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 244 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF9Q13886 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLF9Q13886 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
KLF9Q13886 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLF9Q13886 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLF9Q13886 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLF9Q13886 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
KLF9Q13886 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLF9Q13886 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLF9Q13886 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
KLF9Q13886 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
KLF9Q13886 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLF9Q13886 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLF9Q13886 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLF9Q13886 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLF9Q13886 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLF9Q13886 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLF9Q13886 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLF9Q13886 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLF9Q13886 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLF9Q13886 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLF9Q13886 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLF9Q13886 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLF9Q13886 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLF9Q13886 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLF9Q13886 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KLF9Q13886 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLF9Q13886 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLF9Q13886 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLF9Q13886 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLF9Q13886 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLF9Q13886 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLF9Q13886 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLF9Q13886 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLF9Q13886 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLF9Q13886 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLF9Q13886 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLF9Q13886 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLF9Q13886 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLF9Q13886 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLF9Q13886 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLF9Q13886 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLF9Q13886 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLF9Q13886 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLF9Q13886 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLF9Q13886 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLF9Q13886 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLF9Q13886 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLF9Q13886 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLF9Q13886 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLF9Q13886 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLF9Q13886 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLF9Q13886 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLF9Q13886 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLF9Q13886 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLF9Q13886 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLF9Q13886 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KLF9Q13886 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLF9Q13886 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLF9Q13886 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLF9Q13886 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLF9Q13886 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLF9Q13886 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLF9Q13886 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLF9Q13886 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLF9Q13886 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLF9Q13886 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLF9Q13886 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLF9Q13886 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLF9Q13886 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLF9Q13886 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLF9Q13886 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLF9Q13886 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLF9Q13886 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLF9Q13886 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLF9Q13886 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLF9Q13886 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
KLF9Q13886 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLF9Q13886 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLF9Q13886 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLF9Q13886 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLF9Q13886 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLF9Q13886 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLF9Q13886 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLF9Q13886 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLF9Q13886 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLF9Q13886 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLF9Q13886 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLF9Q13886 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLF9Q13886 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLF9Q13886 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLF9Q13886 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLF9Q13886 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLF9Q13886 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLF9Q13886 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLF9Q13886 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLF9Q13886 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
KLF9Q13886 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLF9Q13886 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLF9Q13886 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KLF9Q13886 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
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