Protein–RNA interactions for Protein: Q13868

EXOSC2, Exosome complex component RRP4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC2Q13868 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EXOSC2Q13868 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
EXOSC2Q13868 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
EXOSC2Q13868 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EXOSC2Q13868 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EXOSC2Q13868 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
EXOSC2Q13868 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EXOSC2Q13868 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
EXOSC2Q13868 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EXOSC2Q13868 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EXOSC2Q13868 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EXOSC2Q13868 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
EXOSC2Q13868 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EXOSC2Q13868 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EXOSC2Q13868 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EXOSC2Q13868 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
EXOSC2Q13868 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EXOSC2Q13868 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
EXOSC2Q13868 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EXOSC2Q13868 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
EXOSC2Q13868 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
EXOSC2Q13868 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EXOSC2Q13868 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EXOSC2Q13868 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EXOSC2Q13868 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
EXOSC2Q13868 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EXOSC2Q13868 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EXOSC2Q13868 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EXOSC2Q13868 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EXOSC2Q13868 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
EXOSC2Q13868 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EXOSC2Q13868 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
EXOSC2Q13868 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
EXOSC2Q13868 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EXOSC2Q13868 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EXOSC2Q13868 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EXOSC2Q13868 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EXOSC2Q13868 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
EXOSC2Q13868 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EXOSC2Q13868 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
EXOSC2Q13868 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EXOSC2Q13868 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
EXOSC2Q13868 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EXOSC2Q13868 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EXOSC2Q13868 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
EXOSC2Q13868 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EXOSC2Q13868 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EXOSC2Q13868 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EXOSC2Q13868 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
EXOSC2Q13868 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
EXOSC2Q13868 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EXOSC2Q13868 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EXOSC2Q13868 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
EXOSC2Q13868 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
EXOSC2Q13868 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
EXOSC2Q13868 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
EXOSC2Q13868 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
EXOSC2Q13868 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
EXOSC2Q13868 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
EXOSC2Q13868 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
EXOSC2Q13868 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
EXOSC2Q13868 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
EXOSC2Q13868 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
EXOSC2Q13868 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
EXOSC2Q13868 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
EXOSC2Q13868 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
EXOSC2Q13868 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
EXOSC2Q13868 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
EXOSC2Q13868 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
EXOSC2Q13868 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
EXOSC2Q13868 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
EXOSC2Q13868 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
EXOSC2Q13868 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
EXOSC2Q13868 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
EXOSC2Q13868 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
EXOSC2Q13868 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
EXOSC2Q13868 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
EXOSC2Q13868 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
EXOSC2Q13868 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
EXOSC2Q13868 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
EXOSC2Q13868 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
EXOSC2Q13868 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
EXOSC2Q13868 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
EXOSC2Q13868 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
EXOSC2Q13868 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
EXOSC2Q13868 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
EXOSC2Q13868 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
EXOSC2Q13868 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
EXOSC2Q13868 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
EXOSC2Q13868 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
EXOSC2Q13868 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
EXOSC2Q13868 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
EXOSC2Q13868 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
EXOSC2Q13868 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
EXOSC2Q13868 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
EXOSC2Q13868 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
EXOSC2Q13868 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
EXOSC2Q13868 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
EXOSC2Q13868 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
EXOSC2Q13868 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
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