Protein–RNA interactions for Protein: Q13635

PTCH1, Protein patched homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTCH1Q13635 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PTCH1Q13635 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PTCH1Q13635 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PTCH1Q13635 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PTCH1Q13635 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PTCH1Q13635 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PTCH1Q13635 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PTCH1Q13635 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PTCH1Q13635 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PTCH1Q13635 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PTCH1Q13635 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
PTCH1Q13635 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PTCH1Q13635 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
PTCH1Q13635 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PTCH1Q13635 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PTCH1Q13635 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PTCH1Q13635 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PTCH1Q13635 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PTCH1Q13635 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
PTCH1Q13635 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PTCH1Q13635 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PTCH1Q13635 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PTCH1Q13635 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
PTCH1Q13635 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PTCH1Q13635 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PTCH1Q13635 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
PTCH1Q13635 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PTCH1Q13635 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
PTCH1Q13635 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PTCH1Q13635 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PTCH1Q13635 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PTCH1Q13635 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PTCH1Q13635 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PTCH1Q13635 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PTCH1Q13635 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PTCH1Q13635 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PTCH1Q13635 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PTCH1Q13635 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PTCH1Q13635 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PTCH1Q13635 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PTCH1Q13635 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PTCH1Q13635 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PTCH1Q13635 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PTCH1Q13635 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
PTCH1Q13635 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PTCH1Q13635 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PTCH1Q13635 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PTCH1Q13635 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PTCH1Q13635 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PTCH1Q13635 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PTCH1Q13635 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
PTCH1Q13635 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PTCH1Q13635 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
PTCH1Q13635 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PTCH1Q13635 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PTCH1Q13635 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PTCH1Q13635 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PTCH1Q13635 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PTCH1Q13635 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PTCH1Q13635 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PTCH1Q13635 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
PTCH1Q13635 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PTCH1Q13635 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PTCH1Q13635 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PTCH1Q13635 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PTCH1Q13635 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PTCH1Q13635 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PTCH1Q13635 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PTCH1Q13635 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PTCH1Q13635 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PTCH1Q13635 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PTCH1Q13635 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PTCH1Q13635 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PTCH1Q13635 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PTCH1Q13635 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PTCH1Q13635 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PTCH1Q13635 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PTCH1Q13635 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PTCH1Q13635 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PTCH1Q13635 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PTCH1Q13635 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC25.64■■□□□ 1.69
PTCH1Q13635 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
PTCH1Q13635 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
PTCH1Q13635 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PTCH1Q13635 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PTCH1Q13635 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PTCH1Q13635 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PTCH1Q13635 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PTCH1Q13635 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PTCH1Q13635 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PTCH1Q13635 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PTCH1Q13635 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PTCH1Q13635 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PTCH1Q13635 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PTCH1Q13635 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PTCH1Q13635 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
PTCH1Q13635 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PTCH1Q13635 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PTCH1Q13635 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PTCH1Q13635 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.6 ms